TruSight RNA融合面板
提供福尔马林固定，石蜡包埋(FFPE)和其他癌症研究样本的综合基因融合检测。阅读更多…
这种靶向RNA测序面板是一种具有成本效益的解决方案，用于检测多种癌症类型的基因融合，无论起源如何。覆盖507个融合相关基因，一个单一的检测方法使研究人员能够评估血液、骨髓和FFPE样本中大多数已知的癌症相关融合，并有能力识别新的融合基因伙伴。
仪器上融合呼叫为实验室提供基于ngs的融合检测，无需额外的生物信息学支持。该分析提供了检测到的融合、相关疾病关联(由Mitelman数据库确定)以及融合支持reads的证据。
该实验只需要20 ng FFPE RNA或10 ng新鲜冷冻总RNA即可。TruSight RNA融合面板为癌症研究中的基因融合研究提供了一种敏感、可重复和经济的解决方案。
| 仪器 | 推荐样本数量 | 读取长度 |
|---|---|---|
| MiniSeq系统 | 每次运行的样本:中输出:2-3，高输出:8(基于每个样本300万次读取) | 2 × 76 bp(建议最大) |
| MiSeq系统 | 每次运行8个样品，使用v3试剂(基于每个样品300万次读取) | 2 × 76 bp(建议最大) |
| NextSeq 550系统 | 每次运行24个样本(中间输出;基于每个样本300万次阅读) | 2 × 76 bp(建议最大) |
| TruSight RNA融合面板 | TruSight肿瘤170 | AmpliSeq用于Illumina焦点面板 | AmpliSeq for Illumina综合面板v3 | |
|---|---|---|---|---|
| 试验时间 | 2.5天 | ~2天(图书馆预备) | 5-6小时(仅限图书馆准备;不包括库量化、规范化或池化时间) | 5-6小时(仅限图书馆准备;不包括库量化、规范化或池化时间) |
| 癌症类型 | 泛癌，实体瘤 | 固体肿瘤 | 固体肿瘤 | 固体肿瘤 |
| 实践时间 | 11个小时 | ~ 10.5小时 | < 1.5小时 | < 1.5小时 |
| 输入数量 | 10 ng总RNA, 20-100 ng FFPE RNA | 40ng DNA和/或RNA | 1-100纳克(建议每个泳池10纳克) | 1-100纳克(建议每个泳池10纳克) |
| 方法 | 目标浓缩，目标浓缩，靶向RNA测序 | 目标浓缩，目标浓缩，靶向DNA测序，靶向RNA测序 | 扩增子测序，靶向DNA测序，靶向RNA测序 | 扩增子测序，靶向DNA测序，靶向RNA测序 |
| 核酸类型 | 核糖核酸 | RNA、DNA | DNA, RNA | DNA, RNA |
| 专门的样本类型 | FFPE组织，低输入样本 | FFPE组织，低输入样本 | FFPE组织 | FFPE组织 |
| 物种分类 | 人类 | 人类 | 人类 | 人类 |
小册子| pdf6mb
数据表| PDF1 MB
product_file | EXCEL< 1mb
