Trusight RNA泛癌板
针对1385个癌基因，在血液、骨髓、福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织等多种RNA样本中进行基因表达、变异和融合检测研究。阅读更多...
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TruSight RNA泛癌面板提供了癌症转录组的全面分析。它提供了:
Trusight RNA Pan-Cances Coare能够进行基因表达的定量测量，以及具有已知和新的基因融合伙伴的基因融合。面板可容纳至少10ng的总RNA输入（或来自FFPE样品的20ng）。关注相关基因子集的焦点使RNA-SEQ能够在桌面定序器上运行的8个样本具有高灵敏度，允许对任何实验室进行成本有效的NGS。
可以使用RNA-SEQ对齐这个直观的工具可以进行融合调用和变异检测，并提供基因表达谱，为所有癌症研究人员提供全面的解决方案。
使用TruSight RNA Pan-Cancer Panel制备10 ng的人内参RNA (UHR)、人内参脑RNA (brain)、细胞系RNA (MCF7)和20 ng的乳腺肿瘤FFPE RNA (BT)，并在MiSeq系统上进行测序。读取映射和融合调用使用RNA-Seq对齐应用程序与BaseSpace Sequence Hub上的STAR对准器。
使用TruSight RNA Pan-Cancer面板制备人参考RNA (HBRR和UHRR)、细胞系RNA (MCF7)和乳腺肿瘤RNA样本，8份样本在MiniSeq系统上以2x76bp的读长进行单标度测序。总收率为4.2 Gb，碱基在Q30及以上的占96.8%。
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| 仪器 | 推荐的样品数量 | 读长度 |
|---|---|---|
| MiniSeq系统 | 每次运行的样本:中输出:2-3，高输出:8(基于每个样本300万读取) | 2×75 BP（Max推荐） |
| MiSeq系统 | 每次使用v3试剂的8个样品（基于每个样本的300万读数） | 2×75 BP（Max推荐） |
| TruSight RNA Pan-Cancer | TruSight RNA融合面板 | |
|---|---|---|
| 试验时间 | 2.5天 | 2.5天 |
| 癌症类型 | 泛癌 | Pan-Cancer,固体肿瘤 |
| 内容规范 | 泛癌盘区，具有1,385个靶向基因和21,043个靶向外偏振区域。包括参与癌症基因融合的507个基因。 | 基因融合面板靶向507个癌症相关的融合基因和7690个外显子 |
| 描述 | 综合评估癌症相关的RNA转录物，使得能够研究基因融合，变体和多种癌症类型的变化。 | 使基因融合检测研究在507个融合相关基因中具有已知和新的伴侣，具有简单的分析溶液。 |
| 实践时间 | 11个小时 | 11个小时 |
| 输入数量 | 总RNA 10 ng, FFPE RNA 20 ~ 100 ng | 总RNA 10 ng, FFPE RNA 20 ~ 100 ng |
| 专门的样本类型 | FFPE组织，低输入样品 | FFPE组织，低输入样品 |
| 物种分类 | 人类 | 人类 |
技术说明| PDF1 MB
产品信息表|Excel <1 MB
数据表| PDF< 1mb
