TruSight RNA Pan-Cancer面板
针对1385年癌症基因表达的基因,变体,和融合检测研究在许多RNA样本类型包括血液、骨髓,formalin-fixed,石蜡包埋组织(FFPE)。阅读更多…
订单你MiniSeq试剂和图书馆准备一起包额外的储蓄和方便。选择项20005611和添加到您的购物车。
TruSight RNA Pan-Cancer面板提供了一个综合分析转录组的癌症。它提供了:
TruSight RNA Pan-Cancer面板使定量测定基因表达的基因融合的检测已知和小说基因融合的合作伙伴。面板提供尽可能少10 ng总RNA的输入(或20 ng FFPE样品)。关注的一个子集相关基因使RNA-Seq台式测序仪具有灵敏度高,允许有效的访问门店对于任何实验室。
分析可以执行使用BaseSpace RNA-Seq校准程序。这个直观的工具执行融合调用和变异检测,并提供基因表达谱,为癌症研究人员提供一个全面的解决方案。
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注册中心BaseSpace序列
10 ng人类参考RNA(表),人类大脑参考RNA(大脑)细胞株RNA (MCF7)和20 ng的乳腺肿瘤FFPE RNA (BT)准备使用TruSight RNA Pan-Cancer面板和测序MiSeq系统。读映射和融合要求进行使用RNA-Seq对齐与星对准器应用BaseSpace序列中心。
人类参考RNA (HBRR和UHRR)细胞株RNA (MCF7)和乳腺肿瘤RNA样本准备使用TruSight RNA Pan-Cancer面板,和8个样本测序MiniSeq系统与单一索引2 x76bp读取长度。总收率为4.2 Gb Q30以上有96.8%的基地。
| 仪器 | 推荐的样品数量 | 读取长度 |
|---|---|---|
| MiniSeq系统 | 样品每运行:中期输出:2 - 3,高输出:8(基于300万读/样本) | 2×75个基点(max推荐) |
| MiSeq系统 | 每运行v3 8样本试剂(基于300万读/样本) | 2×75个基点(max推荐) |
| TruSight RNA Pan-Cancer | TruSight RNA融合小组 | |
|---|---|---|
| 试验时间 | 2.5天 | 2.5天 |
| 癌症类型 | Pan-Cancer | Pan-Cancer,固体肿瘤 |
| 内容规范 | Pan-cancer小组1385个目标基因和21043个目标其实地区。包括507个基因参与癌症基因融合。 | 基因融合小组针对507个癌症相关融合基因和7690个外显子 |
| 描述 | 综合评估癌症相关的RNA转录基因融合,使得研究变异,基因表达多种癌症类型的变化。 | 使基因融合检测研究与已知的和小说的合作伙伴在507年fusion-associated基因,用一个简单的分析解决方案。 |
| 实践时间 | 11个小时 | 11个小时 |
| 输入数量 | 10 ng总RNA, 20 - 100 ng FFPE RNA | 10 ng总RNA, 20 - 100 ng FFPE RNA |
| 专门的样本类型 | FFPE组织,低投入的样本 | FFPE组织,低投入的样本 |
| 物种分类 | 人类 | 人类 |
