illumina的扩增率BRCA.Panel是一种针对体细胞和种系变异研究的靶向重测序分析方法BRCA1和BRCA2基因。主要功能包括:
这BRCA.面板是综合工作流程的一部分,包括用于Illumina聚合酶链反应(PCR)的文库制备,通过合成(SBS)下一代测序(NGS)技术的Illumina测序和自动分析。
BRCA1和BRCA2是人肿瘤抑制基因,当携带特定突变时,患有乳腺癌和卵巢癌的风险增加。此即用的面板可节省研究人员识别目标,设计引物和优化面板的时间和精力。
仪器 | 推荐的样品数量 | 读长度 |
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ISEQ 100系统 | 每次运行12个样本(假设最小覆盖范围为500×) 每次运行96个样本(假设最小覆盖50倍) |
2×150 bp 2×150 bp |
MiniSeQ系统 | 每个运行样本:中间输出:24,高输出:80(假设最小覆盖500×) | 2×150 bp |
miseq系统 | 按照500倍的最小覆盖范围(通过试剂盒版本):V2 Nano:3,V2 Micro:12,V2:48,V3:80 按照50倍的最小覆盖范围(通过Reagent Kit版本):V2 Nano:32,V2 Micro:96 |
2×150 bp 2×150 bp |
Illumina BRCA面板的扩增仪 | TruSight癌症 | |
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测定时间 | 5小时(仅限图书馆准备;不包括库量化,归一化或汇集时间) | 1.5天 |
癌症类型 | 实体瘤 | Pan-Cancer |
内容规范 | 偏振区域和侧翼内读序列BRCA1和BRCA2 | 固定的一组探针,其丰富的94个基因和与常见和罕见癌症相关的284个SNP。 |
描述 | 种系和体细胞分析研究BRCA1和BRCA2。 | 常见和稀有癌症的种系突变检测研究。 |
动手 | <1.5小时 | 5个小时 |
输入数量 | 1-100 ng(建议每个池10 ng) | 50 ng DNA |
方法 | 扩增子测序那有针对性的DNA测序 | 目标浓缩,靶心富集,有针对性的DNA测序 |
多路复用 | 96双指标组合 | 高达96-plex |
专门的样品类型 | 血液,FFPE组织 | 不兼容FFPE |
物种类别 | 人类 | 人类 |
变体类 | 种系变体,插入 - 缺失(诱导),单核苷酸多态性(SNP),体细胞变异 | 种系变体 |
应用笔记|PDF <1 MB
用于Illumina测序板的SomexISE的自动化解决方案
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AmpliSeq for Illumina BRCA面板数据表
数据表|HTML.