使用扩增率为Illumina Custom RNA面板,以测量单一测定中12至1200个基因靶标中的基因表达。您可以使用DesignStudio软件,基于Web的测定设计软件工具轻松地从20,000个人Refseq基因的菜单中设计自定义目标面板。主要功能包括:
Illumina Custom RNA面板的扩增是集成工作流程的一部分,包括用于Illumina聚合酶链反应(PCR)的文库制剂的扩增,通过合成(SBS)化学和下一代测序(NGS)技术,以及自动分析.
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试验时间 | 5.5 - -7.5小时 | 1天 |
动手 | < 1.5小时 | 4个小时 |
输入数量 | 1 ng | 50 ng RNA, 50 ng优质总RNA,≥200 ng FFPE总RNA;推荐的数量可能因表达水平、目标的多样性和样本质量而异 |
行动机制 | 多重聚合酶链反应 | 放大 |
方法 | 扩增子测序,自定义排序,有针对性的RNA测序 | 有针对性的RNA测序 |
多路复用 | 高达384-plex | 每次测序运行最多384个样本 |
核酸类型 | RNA. | RNA. |
专门的样品类型 | 血,FFPE组织 | FFPE组织,低输入样本 |
物种分类 | 人类 | 人类,老鼠,老鼠 |
系统的兼容性 | iSeq 100,MiniSeq.,Miseq.MiSeq,NextSeq 2000,NextSeq 500,NextSeq 550 | MiniSeq.,Miseq.MiSeq,NextSeq 2000,NextSeq 500,NextSeq 550 |
变量类 | 记录变种 | 基因融合,单核苷酸多态性(SNPs),转录本变异 |
Illumina定制RNA面板的AmpliSeq,全转录组和qPCR的表达谱比较
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使用QPCR移动到自定义RNA-SEQ,并为Illumina定制RNA面板应用笔记
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