AmpliSeq Illumina公司外显子组面板
有针对性的研究小组测序人类基因组的编码蛋白质的区域。阅读更多…
面板
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AmpliSeq Illumina公司外显子组面板带来的速度和简单PCR外显子组测序,使研究人员能够序列8外显在一个运行在更短的时间内和识别生殖系变异。主要特点包括:
外显子组面板是一个集成的工作流的一部分,包括AmpliSeq Illumina公司基于聚合酶链反应(PCR)的图书馆准备,Illumina公司综合排序(SBS)下一代测序(上天)技术和自动分析。
这个现成的面板可以节省你的时间和精力识别目标,设计引物,优化面板。
| 仪器 | 推荐的样品数量 | 读取长度 |
|---|---|---|
| NextSeq 550系统 | 样品每运行:高输出:每运行8样本(基于覆盖30×> 95%) | 2 x 151个基点 |
| AmpliSeq Illumina公司外显子组面板 | TruSeq基因外显子组 | Nextera基因外显子组 | Nextera Flex进行浓缩 | |
|---|---|---|---|---|
| 试验时间 | < 7.5小时(图书馆准备;不包括图书馆量化、规范化或池时间) | 2.5天 | < 2.5天 | ~ 6.5小时 |
| 内容规范 | > 97%的ccd | 捕捉编码外显子。其实内容涵盖45 Mb(≥98%的RefSeq、ccd和运用编码内容)。 | 捕捉编码外显子。其实内容涵盖45 Mb(≥98%的RefSeq、ccd和运用编码内容)。 | 外显子组:45 Mb其实内容(≥98%的RefSeq、ccd和运用编码内容)。 定义:0.5 - 15 Mb基因感兴趣的内容。 固定板:内容不同的面板。 |
| 描述 | 使研究人员准备8外显子组库在< < 1.5小时的时间7.5小时。 | 具有成本效益的外显子组研究工作流集中在≥98%的RefSeq, ccd,运用编码内容。 | 具有成本效益的外显子组研究工作流集中在≥98%的RefSeq, ccd,运用编码内容。 | 研究一种快速、灵活的解决方案,使whole-exome,习俗,和固定面板有针对性的测序。 |
| 实践时间 | < 1.5小时 | 6个小时 | 3个小时 | ~ 2个小时 |
| 输入数量 | 50 ng最低 | 100 ng基因组DNA | 50 ng基因组DNA | 10 - 1000 ng高质量基因组DNA或50 - 1000 ng FFPE DNA。(血液和唾液,见参考指南)。 |
| 的作用机制 | 多重聚合酶链反应 | 机械与生物素化的碎片(Covaris)和外显子组浓缩捕获探针 | Transposase-based碎片和外显子组浓缩生物素化的捕获探针 | Enrichment-compatible, bead-linked transposome |
| 方法 | 扩增子测序,外显子组测序 | 外显子组测序 | 外显子组测序 | 自定义排序,外显子组测序,目标浓缩目标浓缩,有针对性的DNA测序 |
| 多路复用 | 96双指数组合 | 到12-plex浓缩 | 到12-plex浓缩 | 384独特的双索引可用。预富集的池12-plex测试。 |
| 目标读 | > 80% | > 80% | > 75% | ≥85%(外显子组面板) |
| 专门的样本类型 | 不是FFPE-Compatible | FFPE组织 | 低投入的样品,而不是FFPE-Compatible | 血,FFPE组织,唾液 |
| 物种分类 | 人类 | 人类 | 人类 | 人类,其他 |
| 均匀性 | > 90%(%覆盖率在20 x 4 Gb) | > 85%(%覆盖率在20 x 4 Gb) | > 75%(%覆盖率在20 x 4 Gb) | ≥90%(%覆盖率在20 x 4 Gb;外显子组面板) |
Illumina公司测序电池板AmpliSeq自动化解决方案
应用程序注意| HTML
样本识别的AmpliSeq Illumina公司ID面板应用程序
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数据表| HTML
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