AmpliSeq用于Illumina TCR beta-SR面板

ffpe兼容面板,通过测序T细胞受体β链重排,测量T细胞多样性和肿瘤样本中的克隆扩增。阅读更多…
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面板

AmpliSeq™用于Illumina®TCR beta-SR面板

20031675

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图书馆准备

Illumina®的AmpliSeq™Library PLUS (24 Reactions

20019101

价格

Illumina®的AmpliSeq™Library PLUS (96 Reactions)

20019102

价格

AmpliSeq™Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®

20019103

价格

指数适配器

AmpliSeq™UD Indexes for Illumina®(24指数,24样品)

20019104

价格

AmpliSeq™CD索引为Illumina®设置A

20019105

价格

AmpliSeq™CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

价格

AmpliSeq™CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

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AmpliSeq™CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

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AmpliSeq™CD Indexes Set A-D for Illumina®(384 Indexes, 384 Samples)

20031676

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附件的产品
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Ampliseq™cDNA Synthesis for Illumina®

20022654

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AmpliSeq™Library Equalizer for Illumina®

20019171

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AmpliSeq™用于Illumina®直接FFPE DNA

20023378

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产品亮点

AmpliSeq for Illumina TCR beta-SR (Short Read) Panel是一种高度多路靶向重测序面板,用于多种样本类型,包括福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)肿瘤样本。它的设计是通过测序T细胞受体(TCR) β链重排来测量T细胞多样性和克隆扩增。您可以使用单一的多重PCR引物、库试剂和样品条形码库,从FFPE、全血、新鲜冷冻组织或荧光激活细胞分选(FACS)的细胞中提取DNA/RNA,生成库。

主要特点包括:

  • 高价值的内容
    获得TCR β链序列的全面覆盖
  • 简单,简化工作流程
    在一天内从FFPE、全血、新鲜/冷冻组织或荧光激活细胞分选(FACS)细胞中制备测序准备库
  • 低输入要求
    用最少10 ng的输入RNA生成高质量的测序库

AmpliSeq for Illumina TCR beta-SR Panel是一个集成工作流的一部分,该工作流包括AmpliSeq for Illumina聚合酶链反应(PCR)为基础的文库制备,Illumina通过合成(SBS)化学和下一代测序(NGS)技术测序,以及自动化分析。

这个随时可用的面板为您节省了识别目标、设计引物和优化面板的时间和精力。它能够表征TCR β链的高变量互补决定区3 (CDR3)。这些信息可以帮助免疫学研究人员了解免疫功能、自身免疫性疾病和免疫介导的不良反应。

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规范

项目建议

仪器 建议样本数目 读取长度
MiniSeq系统 每次运行的样本将取决于样本类型。 2 × 151bp
MiSeq系统 每次运行的样本将取决于样本类型。 2 × 151bp
NextSeq 550系统 每次运行的样本将取决于样本类型。 2 × 151bp

产品的比较

AmpliSeq用于Illumina TCR beta-SR面板 AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel
试验时间 5.5 - -7.5小时 5.5 - 7.5小时(只适用于图书馆;不包括库量化、规范化或池化时间)
内容规范 序列TCR β链重排,具有高达80 bp的读长扩增子用于表征CDR3。 TCRβ链重排的RNA评估,包括CDR1, CDR2和CDR3(带有高达400 bp的阅读长度扩增子)
实践时间 < 1.5小时 < 1.5小时
输入数量 1 ng 10 - 1000 ng
方法 扩增子测序有针对性的DNA测序有针对性的RNA序列 扩增子测序有针对性的RNA序列
核酸类型 DNA, RNA 核糖核酸
专门的样本类型 血液,FACS细胞,FFPE组织,新鲜/冷冻组织 血液,FACS细胞,新鲜/冷冻组织
物种分类 人类 人类
系统的兼容性 MiniSeqMiSeqMiSeq,NextSeq 2000NextSeq 550 MiniSeqMiSeqMiSeq,NextSeq 1000NextSeq 2000NextSeq 550

Method-Specific工作流示例

支持数据及数字

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