AmpliSeq for Illumina TCR beta-SR (Short Read) Panel是一种高度多路靶向重测序面板,用于多种样本类型,包括福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)肿瘤样本。它的设计是通过测序T细胞受体(TCR) β链重排来测量T细胞多样性和克隆扩增。您可以使用单一的多重PCR引物、库试剂和样品条形码库,从FFPE、全血、新鲜冷冻组织或荧光激活细胞分选(FACS)的细胞中提取DNA/RNA,生成库。
主要特点包括:
AmpliSeq for Illumina TCR beta-SR Panel是一个集成工作流的一部分,该工作流包括AmpliSeq for Illumina聚合酶链反应(PCR)为基础的文库制备,Illumina通过合成(SBS)化学和下一代测序(NGS)技术测序,以及自动化分析。
这个随时可用的面板为您节省了识别目标、设计引物和优化面板的时间和精力。它能够表征TCR β链的高变量互补决定区3 (CDR3)。这些信息可以帮助免疫学研究人员了解免疫功能、自身免疫性疾病和免疫介导的不良反应。
yobet亚洲亚博官网人口了解更多关于AmpliSeq的Illumina仪器 | 建议样本数目 | 读取长度 |
---|---|---|
MiniSeq系统 | 每次运行的样本将取决于样本类型。 | 2 × 151bp |
MiSeq系统 | 每次运行的样本将取决于样本类型。 | 2 × 151bp |
NextSeq 550系统 | 每次运行的样本将取决于样本类型。 | 2 × 151bp |
AmpliSeq用于Illumina TCR beta-SR面板 | AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel | |
---|---|---|
试验时间 | 5.5 - -7.5小时 | 5.5 - 7.5小时(只适用于图书馆;不包括库量化、规范化或池化时间) |
内容规范 | 序列TCR β链重排,具有高达80 bp的读长扩增子用于表征CDR3。 | TCRβ链重排的RNA评估,包括CDR1, CDR2和CDR3(带有高达400 bp的阅读长度扩增子) |
实践时间 | < 1.5小时 | < 1.5小时 |
输入数量 | 1 ng | 10 - 1000 ng |
方法 | 扩增子测序,有针对性的DNA测序,有针对性的RNA序列 | 扩增子测序,有针对性的RNA序列 |
核酸类型 | DNA, RNA | 核糖核酸 |
专门的样本类型 | 血液,FACS细胞,FFPE组织,新鲜/冷冻组织 | 血液,FACS细胞,新鲜/冷冻组织 |
物种分类 | 人类 | 人类 |
系统的兼容性 | MiniSeq,MiSeqMiSeq,NextSeq 2000,NextSeq 550 | MiniSeq,MiSeqMiSeq,NextSeq 1000,NextSeq 2000,NextSeq 550 |