呼吸道病原体ID/AMR富集试剂盒是基于下一代测序(NGS)的呼吸道病原体面板,提供高度敏感、全面的病原体检测和抗药性(AMR)见解。浓缩小组针对超过280种呼吸道病原体,包括SARS-CoV-2和其他病毒、细菌和真菌,以及1200+AMR等位基因。
由IDbyDNA Explicify分析软件提供支持,灵活可扩展的端到端工作流程,加上在24小时内广泛识别呼吸道病原体和AMR等位基因,为临床研究环境中检测呼吸道感染提供了快速、经济高效的解决方案。
此工作流程的功能:
使用IDbyDNA Explify平台进行功能强大、简单的数据分析
IDbyDNA Explicify RPIP Analysis应用程序为Illumina呼吸道病原体ID/AMR浓缩试剂盒提供了一个配对和定制的数据分析解决方案。该应用程序提供有关样本组成的信息,包括宿主和微生物丰度,以及目标序列与非目标序列的比例。
此应用程序可在Basespace序列集线器中使用。用户可以选择最多35个单独的样本或包含任何用于分析样本的项目文件夹。该应用程序提供了四种不同格式的结果:(1)摘要报告(PDF),(2)带注释的SARS-COV-2和流感A / B(TSV)的突变表,(3)SARS-COV-2共识基因组(FASTA)和(4)详细的基于文本的报告(JSON)。
在BaseSpace Sequence Hub中访问此应用程序
见解释呼吸ID/AMR分析用户指南更多信息。
呼吸病原体ID / AMR浓缩面板套件(由IDByDNA推出爆炸) | 呼吸道病毒寡核苷酸面板 | |
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分析时间 | <9小时图书馆准备时间 | <9小时图书馆准备时间 |
自动化能力 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
描述 | A streamlined workflow using Respiratory Pathogen ID/AMR Panel (RPIP) with Illumina RNA Prep with Enrichment, sequencing on Illumina desktop systems, and powerful analysis using IDbyDNA’s Explify Platform allows researchers to identify respiratory infections and co-infections, identify antimicrobial resistance, and perform strain typing of critical pathogens (SARS-CoV-2 and Flu A/B viruses) to study viral evolution and transmission. | 使用RNA Prep进行富集,结合呼吸道病毒寡聚物面板进行文库制备,经验证的Illumina测序,以及使用DRAGEN RNA病原体检测应用程序或BaseSpace测序中心上的IDbyDNA Explify RVOP应用程序进行简化的数据分析,为检测和分析SARS-CoV-2和其他常见呼吸道病毒提供了一个简化的工作流程。 |
准时到达 | <2小时库准备时间 | <2小时库准备时间 |
多路复用 | 单个运行中最多384个样本,具有独特的双索引 | 单个运行中最多384个样本,具有独特的双索引 |
物种类别 | 细菌,真菌,病毒 | 人类病毒 |
物种详情 | 检测呼吸道病原体(180+细菌、50+真菌和40+病毒,包括SARS-CoV-2)和抗药性等位基因(1200+)。 | 检测常见的呼吸道病毒,包括最近的流感病毒株和SARS-CoV-2。包括人体探针作为质量特征,每个样本中都包括人体探针。 |
系统兼容性 | MiniSeq.,米塞克,MiSeq,NextSeq 550 | MiniSeq.,米塞克,MiSeq,NextSeq 550 |
使用MiniSeq系统全面快速检测呼吸道病原体和相关耐药基因
申请须知| PDF<1 MB
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产品信息表| PDF<1 MB
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数据表| PDF<1 MB