呼吸病原体ID / AMR浓缩面板套件(由IDByDNA推出爆炸)

该NGS小组针对超过280种呼吸道病原体(包括SARS-CoV-2)和1200多种抗药性等位基因,数据分析由IDbyDNA提供支持。阅读更多...
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呼吸道病原体ID/AMR富集试剂盒套件A(RUO)(96个指标,96个样本)

20047050

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呼吸道病原体ID/AMR富集试剂盒B组(RUO)(96个指标,96个样本)

20046969.

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产品亮点

呼吸道病原体ID/AMR富集试剂盒是基于下一代测序(NGS)的呼吸道病原体面板,提供高度敏感、全面的病原体检测和抗药性(AMR)见解。浓缩小组针对超过280种呼吸道病原体,包括SARS-CoV-2和其他病毒、细菌和真菌,以及1200+AMR等位基因。

由IDbyDNA Explicify分析软件提供支持,灵活可扩展的端到端工作流程,加上在24小时内广泛识别呼吸道病原体和AMR等位基因,为临床研究环境中检测呼吸道感染提供了快速、经济高效的解决方案。

此工作流程的功能:

  • 呼吸道病原体的普遍检测-提供关键病原体的全面检测,包括SARS-CoV-2。呼吸道病原体专家组(RPIP)同时检测180多种细菌、50多种真菌和40多种病毒的RNA和DNA。
  • 抗菌药物耐药基因的检测-基于检测>1200个相关AMR标记物准确预测16种常见呼吸道病原体对60种相关抗生素的耐药性
  • 应变键入关键病原体-报告SARS-CoV-2和流感A/B病毒的全基因组覆盖率,以监测新的变异和谱系
  • 质量控制- 包括靶向10个市售的尖峰控制选项的探针。
  • 成本效益- 综合呼吸道理面板设计使得能够经济有效地检测RNA和DNA呼吸道病原体和抗微生物抗性等一于相同的测定。
  • 迅速的–使用MiniSeq快速试剂盒在24小时内同时检测细菌、病毒、真菌和AMR等位基因。

使用IDbyDNA Explify平台进行功能强大、简单的数据分析

IDbyDNA Explicify RPIP Analysis应用程序为Illumina呼吸道病原体ID/AMR浓缩试剂盒提供了一个配对和定制的数据分析解决方案。该应用程序提供有关样本组成的信息,包括宿主和微生物丰度,以及目标序列与非目标序列的比例。

此应用程序可在Basespace序列集线器中使用。用户可以选择最多35个单独的样本或包含任何用于分析样本的项目文件夹。该应用程序提供了四种不同格式的结果:(1)摘要报告(PDF),(2)带注释的SARS-COV-2和流感A / B(TSV)的突变表,(3)SARS-COV-2共识基因组(FASTA)和(4)详细的基于文本的报告(JSON)。

在BaseSpace Sequence Hub中访问此应用程序

解释呼吸ID/AMR分析用户指南更多信息。

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规格

产品比较

呼吸病原体ID / AMR浓缩面板套件(由IDByDNA推出爆炸) 呼吸道病毒寡核苷酸面板
分析时间 <9小时图书馆准备时间 <9小时图书馆准备时间
自动化能力 液体处理机器人 液体处理机器人
描述 A streamlined workflow using Respiratory Pathogen ID/AMR Panel (RPIP) with Illumina RNA Prep with Enrichment, sequencing on Illumina desktop systems, and powerful analysis using IDbyDNA’s Explify Platform allows researchers to identify respiratory infections and co-infections, identify antimicrobial resistance, and perform strain typing of critical pathogens (SARS-CoV-2 and Flu A/B viruses) to study viral evolution and transmission. 使用RNA Prep进行富集,结合呼吸道病毒寡聚物面板进行文库制备,经验证的Illumina测序,以及使用DRAGEN RNA病原体检测应用程序或BaseSpace测序中心上的IDbyDNA Explify RVOP应用程序进行简化的数据分析,为检测和分析SARS-CoV-2和其他常见呼吸道病毒提供了一个简化的工作流程。
准时到达 <2小时库准备时间 <2小时库准备时间
多路复用 单个运行中最多384个样本,具有独特的双索引 单个运行中最多384个样本,具有独特的双索引
物种类别 细菌,真菌,病毒 人类病毒
物种详情 检测呼吸道病原体(180+细菌、50+真菌和40+病毒,包括SARS-CoV-2)和抗药性等位基因(1200+)。 检测常见的呼吸道病毒,包括最近的流感病毒株和SARS-CoV-2。包括人体探针作为质量特征,每个样本中都包括人体探针。
系统兼容性 MiniSeq.,米塞克,MiSeq,NextSeq 550 MiniSeq.,米塞克,MiSeq,NextSeq 550

示例工作流程

支持数据和数字

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