Illumina RNA Prep with Enrichment
以卓越的捕获效率和覆盖均匀性实现对大量目标基因的快速、有针对性的查询。阅读更多…
图书馆准备
指数适配器
面板
总:
*提供只适用于图书馆备用包。索引适配器和面板不包括在此促销中。
Illumina RNA Prep with Enrichment使用珠上标记技术，然后是简化的单一杂交，为基于RNA的文库制备和富集提供了异常快速的工作流程。
在少于9小时的总时间和少于2小时的动手时间内准备和丰富库。与TruSeq RNA外显子组相比，该工作流程节省了50%以上的时间。illumina合格的自动化选项很快就会通过我们的自动化合作伙伴．
从新鲜或冷冻样品中提取10 ng总RNA，或从降解样品(如FFPE)中提取20 ng总RNA，获得高灵敏度。
分离目标转录组编码区域可以在测序深度的一小部分最大化发现能力。Illumina RNA Prep with Enrichment的设计目的是提供卓越的捕获效率和覆盖均匀性，最大限度地减少所需的测序深度，以实现无偏差的精确检测。每次富集反应仅需2.5 μ L探针。
从各种预构建的、经过验证的探测池中进行选择，或者自定义您自己的探测，以获得最大的灵活性。使用新的惟一双索引集C和D(即将推出)在一次运行中复用多达384个样本。模块化设计支持跨感兴趣区域的广泛RNA-Seq应用，实现检测和发现研究，如等位基因特异性表达、融合检测、生物标志物筛选等。
实现快速，有针对性的讯问的目标基因的数量，包括RNA外显子组。Illumina RNA Prep with Enrichment可以与Illumina外显子组面板一起使用，该面板具有高度优化的探针集，提供编码RNA序列的全面覆盖。Illumina外显子组面板包括> 425,000个探针，每个探针针对NCBI37/hg19参考基因组构建，覆盖了> 98%的RefSeq外显子组。该探针集捕获了> 214,000个靶标，涵盖21,415个感兴趣的基因。
呼吸道病毒Oligo面板可对常见呼吸道病毒(包括冠状病毒株)进行高度灵敏的检测和表征。用于基于混合捕获的目标富集的寡核苷酸探针即使在高诱变区域仍然有效，允许靶向快速进化的RNA病毒。使用呼吸道病毒Oligo面板与Illumina RNA Prep富集。
亚博官网人口| 仪器 | 建议样本数量 | 读取长度 |
|---|---|---|
| NextSeq 550系统 | Illumina RNA Prep与富集+外显子组面板 中期输出:5 高输出:16 (基于每个样本25M次读取) |
2 × 100 bp |
| NextSeq 2000系统 | Illumina RNA Prep与富集+外显子组面板 P2: 16 P3: 40 (基于每个样本25M次读取) |
2 × 100 bp |
| NovaSeq 6000系统 | Illumina RNA Prep与富集+外显子组面板 SP: 32 S1: 64 S2: 164 S4: 384 (基于每个样本25M次读取) |
2 × 100 bp |
| iSeq 100系统 | Illumina RNA Prep与富集+呼吸道病毒面板 8个(基于每个样本500K次读取) |
2 × 75 bp |
| MiSeq系统,MiSeq | Illumina RNA Prep与富集+呼吸道病毒面板 1-50(基于每个样本500K读取) |
2 × 75 bp |
| MiniSeq系统 | Illumina RNA Prep与富集+呼吸道病毒面板 8-50(基于每个样本500K读取) |
2 × 75 bp |
| NextSeq 550系统 | Illumina RNA Prep与富集+呼吸道病毒面板 260-384(基于每个样本500K读取) |
2 × 75 bp |
| Illumina RNA Prep with Enrichment | TruSeq RNA外显子组 | Illumina链mRNA准备 | |
|---|---|---|---|
| 试验时间 | < 9小时 | ~ 2天 | 6.5小时 |
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| 内容规范 | 与Illumina Exome Panel一起使用时捕获编码转录组 | 捕获编码转录组/RNA外显子组 | 捕获带有链信息的编码转录组 |
| 描述 | 一种可复制的，经济的解决方案，能够从广泛的样品类型和输入，包括福尔马林固定，石蜡包埋(FFPE)组织和其他低质量的样品中进行靶向转录本检测和发现 | 通过精确的链信息和减少样本输入要求，使研究人员对编码转录组有一个清晰、全面的了解。 | 一种简单，经济的解决方案，分析编码转录组与精确的链信息 |
| 实践时间 | < 2小时 | ~ 11个小时 | < 3小时 |
| 输入数量 | 10ng新鲜/冷冻样品的总RNA，或20ng FFPE样品的总RNA | 来自新鲜/冷冻样品的总RNA为10ng，或来自FFPE样品的总RNA为20ng | 25- 1000ng标准质量总RNA |
| 的作用机制 | Bead-linked transposome | 生物素化捕获探针靶向编码RNA。不需要有多a尾的RNA。 | PolyA捕获，基于连接的适配器和索引的添加 |
| 方法 | 信使rna序列，目标浓缩目标浓缩,有针对性的RNA序列 | 外显子组测序，信使rna序列 | 信使rna序列 |
| 多路复用 | 多达384个唯一双索引(UDIs) | 多达24个单体，96个组合(CD)对偶 | 多达384个唯一双索引(UDIs) |
| 技术 | 测序 | 测序 | 测序 |
| 变量类 | 基因融合，新的转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 | 新转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 | 基因融合，新的转录本，单核苷酸多态性(SNPs)，转录本变异 |
与TruSeq RNA外显子组相比，珠上标记和一个90分钟的杂交步骤结合起来提供了更快的工作流程，步骤更少。
Illumina RNA Prep with Enrichment从通用人类参考文献(UHR)中获得了10 ng到100 ng总RNA输入量的高数据一致性。UHR RNA文库在NovaSeq 6000系统上测序，每个文库采样25M个簇。使用BaseSpace RNA-Seq Alignment v 1.1.1应用程序分析数据。
使用Illumina RNA Prep with Enrichment和Illumina外显子组面板从K-562细胞系中提取10 ng RNA制备文库，成功检测BCR-ABL1基因融合。顶部对齐轨迹显示所有读取，底部对齐轨迹显示仅支持BCR-ABL1融合基因的读取。
| 融合(源) | RIN | RNA的输入 | 检测 |
|---|---|---|---|
| bcr - abl 1(k - 562) | 7.4 | 10 ng | 6/6(100%)的复制 |
| TPM3-NTRK1(结直肠癌) | 2.5 | 20 ng | 6/6(100%)的复制 |
使用Illumina RNA Prep with Enrichment和Illumina外显子组面板从10 ng UHR RNA和20 ng FFPE RNA制备的文库显示，超过85%的生成数据与转录本(编码和utr)对齐。TruSeq RNA外显子组文库的数据用于比较。
Illumina RNA Prep with Enrichment
数据表| PDF< 1 MB
使用Illumina RNA Prep with Enrichment检测和表征呼吸道病毒，包括SARS-CoV-2
应用说明| PDF< 1 MB
