Illumina RNA准备富集
以优异的捕获效率和覆盖均匀性，实现对大量目标基因的快速、有针对性的询问。阅读更多…
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Illumina RNA文库与富集训练准备
20044763
总:
*首次购买单个图书馆准备工具包的有效期至2021年6月30日。此升级不包括索引适配器和面板。
Illumina RNA文库与富集训练准备
20044763
Illumina RNA Prep with Enrichment使用On-Bead标记技术，然后进行简化，单杂交，为基于RNA的文库制备和富集提供异常快速的工作流程。
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准备和丰富图书馆在少于9小时的总时间和少于2小时的实践时间。与TruSeq RNA外显子组相比，这个工作流程节省了50%以上的时间。illumina认证的自动化选项即将通过我们自动化伙伴．
从新鲜或冷冻样本中获得低至10ng总RNA或从降解样本(如FFPE)中获得20ng总RNA的高灵敏度。
隔离靶转录组编码区域在测序深度的一部分下最大化发现功率。Illumina RNA制备具有富集的旨在提供卓越的捕获效率和覆盖均匀性，最大限度地减少所需的测序深度，以便在没有偏压的情况下进行精确检测。每种富集反应仅需要2.5μL探针。
从各种预构建的、经过验证的探测池中进行选择，或自定义自己的探测，以获得最大的灵活性。使用新的唯一双索引集C和D(即将推出)在一次运行中复用多达384个样本。该模块化设计支持广泛的RNA-Seq应用，跨越感兴趣的区域，使检测和发现研究，如等位基因特异性表达，融合检测，生物标志物筛选，等等。
实现快速，有针对性地询问大量的目标基因，包括RNA外显子组。Illumina RNA Prep with Enrichment可以与Illumina外显子组(Illumina Exome Panel)一起使用，该面板具有高度优化的探针集，提供编码RNA序列的全面覆盖。Illumina外显子组包括> 42.5万个探针，每个探针都是针对NCBI37/hg19参考基因组构建的，覆盖了> 98%的RefSeq外显子组。探针集合捕获> 214,000个靶点，涵盖21,415个感兴趣的基因。
呼吸道病毒Oligo Panel提供对包括冠状病毒毒株在内的常见呼吸道病毒的高度敏感检测和特征描述。用于混合捕获为基础的目标富集的寡聚探针即使在高度诱变区域仍然有效，允许靶向快速进化的RNA病毒。使用呼吸道病毒Oligo面板与Illumina RNA富集Prep。
亚博官网人口| 仪器 | 推荐的样品数量 | 读取长度 |
|---|---|---|
| NextSeq 550系统 | Illumina RNA扩增试剂盒+外显子组 中产阶级：5 高输出:16 （基于每个样本的25米读数） |
2 × 100 bp |
| NextSeq 2000系统 | Illumina RNA扩增试剂盒+外显子组 P2：16 P3: 40 （基于每个样本的25米读数） |
2 × 100 bp |
| NovaSeq 6000系统 | Illumina RNA扩增试剂盒+外显子组 SP：32 S1: 64 S2：164 S4: 384 （基于每个样本的25米读数） |
2 × 100 bp |
| Miseq系统，Miseq | Illumina RNA浓缩+呼吸道病毒Oligo板 多达25个样品(基于1M读取每个样品) |
2 × 75 bp |
| MiniSeq系统 | Illumina RNA浓缩+呼吸道病毒Oligo板 多达25个样品(基于1M读取每个样品) |
2 × 75 bp |
| NextSeq 550系统 | Illumina RNA浓缩+呼吸道病毒Oligo板 多达384个样本(基于每个样本1M的读取) |
2 × 75 bp |
| Illumina RNA准备富集 | TruSeq RNA外显子组 | Illumina链mRNA准备 | |
|---|---|---|---|
| 试验时间 | < 9小时 | ~ 2天 | 6.5小时 |
| 自动化能力 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| 内容规范 | 利用Illumina外显子组捕获编码转录组 | 捕获编码的转录组/RNA外显子组 | 捕获带有链信息的编码转录组 |
| 描述 | 这是一种可重复、经济的解决方案，能够从广泛的样本类型和输入(包括福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织和其他低质量样本)中进行靶向转录本检测和发现 | 给研究人员一个清晰的，全面的看法编码转录组与精确的链信息和减少样本输入的要求。 | 一个简单的，经济的解决方案，分析编码转录组与精确的链信息 |
| 实践时间 | < 2小时 | 〜11小时 | < 3小时 |
| 输入数量 | 新鲜/冷冻样本总RNA含量为10ng, FFPE样本总RNA含量为20ng | 从新鲜/冷冻样本中提取总RNA 10 ng，或从FFPE样本中提取总RNA 20 ng | 25- 1000ng标准质量总RNA |
| 的作用机制 | 珠子连接的转座组 | 靶向编码RNA的生物素化捕获探针。不需要poly-A尾部的RNA。 | PolyA捕获、基于连接的适配器和索引添加 |
| 方法 | 信使rna序列，目标浓缩目标浓缩,有针对性的RNA序列 | exome测序，信使rna序列 | 信使rna序列 |
| 多路复用 | 最多384个独特的双索引（UDIS） | 多达24单，96组合(CD)双 | 最多384个独特的双索引（UDIS） |
| 技术 | 测序 | 测序 | 测序 |
| 变量类 | 基因融合，新型转录物，单核苷酸多态性（SNP），转录物变异 | 新型转录物，单核苷酸多态性（SNP），转录物变体 | 基因融合，新型转录物，单核苷酸多态性（SNP），转录物变异 |
与TruSeq RNA外显子组相比，On-Bead标记和一个单一的、90分钟的杂交步骤结合起来，提供了更快的工作流程和更少的步骤。
Illumina RNA Prep与富集实现了从通用人类参考(UHR)总RNA输入量10 ng和100 ng之间的高数据一致性。UHR RNA库在NovaSeq 6000系统上测序，每个库下采样至25M簇。数据使用BaseSpace RNA-Seq Alignment v 1.1.1 app进行分析。
利用Illumina RNA Prep with Enrichment和Illumina Exome Panel从K-562细胞系中提取10 ng RNA制备文库，成功检测到BCR-ABL1基因融合。顶部对齐轨道显示所有reads，底部对齐轨道仅显示支持BCR-ABL1融合基因的reads。
| 融合（来源） | RIN | RNA的输入 | 检测 |
|---|---|---|---|
| bcr - abl 1(k - 562) | 7．4 | 10 ng | 6/6(100%)的复制 |
| TPM3-NTRK1(结直肠癌) | 2．5 | 20 ng | 6/6(100%)的复制 |
使用Illumina RNA制备方法从10 ng UHR RNA和20ng FFPE RNA中制备的文库，含有富集和Illumina Exome面板，显示出与转录物对齐的85％的数据（编码和UTR）。显示来自Truseq RNA外壳库的数据进行比较。
利用MiniSeq系统全面快速检测呼吸道病原体和相关耐药基因
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使用Illumina RNA Prep与富集的检测和表征呼吸道病毒，包括SARS-COV-2
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使用MiniSeq快速试剂试剂盒和Illumina富集RNA试剂盒快速检测呼吸道病毒
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小册子| PDF1 MB
小册子| PDF2 MB
数据表| PDF6版本
