Illumina链总RNA Prep与核糖零加
从广泛的样本类型中快速制备文库，用于研究编码和非编码转录组，具有无与伦比的研究灵活性。阅读更多…
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*此优惠只适用于图书馆备品包。索引适配器和面板不包括在此促销活动中。
Illumina Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus为编码和多种形式的非编码RNA的分析提供了出色的性能。获得替代性转录本、基因融合和等位基因特异性表达的高可信度发现。
Illumina Total RNA Prep with ripo - zero Plus基于TruSeq连接技术，自2011年以来已被超过9,926篇论文引用。这种连接方法的结果高覆盖均匀性，精确的链信息，以及稳健和可靠的库制备即使从降解样品。
Illumina Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus支持广泛的RNA输入范围，从1 ng到1000 ng*。它兼容多种样品类型，包括福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)和其他低质量样品。包含的Ribo-Zero Plus从多个物种中去除丰富的RNA，包括人类、小鼠、大鼠、细菌和流行病学样本。
在7小时内准备好图书馆。illumina合格的自动化方法将很快通过我们的自动化合作伙伴．
重复多达384个样品和序列在单一运行。(索引集A和B现已提供;C组和D组即将推出。)每次运行测序的样本数量取决于测序仪的吞吐能力。
*此输入范围适用于高质量的RNA。对于FFPE或降解样品，我们建议输入10ng以获得最佳结果。
| 仪器 | 推荐样本数量 | 读取长度 |
|---|---|---|
| NextSeq 550系统 | 中间输出:2 高产量:8 (基于每个样本读取50M) |
2 × 75 bp |
| NextSeq 2000系统 | 全转录组分析: 每次运行8 (P2)-50 (P3)个样本(基于每个样本50M读取) |
2 × 75 bp |
| NovaSeq 6000系统 | 全转录组分析: SP: 16 S1: 32 S2: 82 S4: 384 每次运行的样本(基于每个样本的50M读取) |
2 × 75 bp |
| Illumina链总RNA Prep与核糖零加 | TruSeq总链RNA | TruSeq链总RNA与核糖-零球蛋白 | |
|---|---|---|---|
| 试验时间 | ~ 7小时 | 11.5小时 | |
| 自动化功能 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| 内容规范 | 捕获编码RNA和多种形式的非编码RNA | 捕获编码RNA和多种形式的非编码RNA | 捕获编码RNA和多种形式的非编码RNA |
| 描述 | 用于多种样本类型的全转录组测序研究。包括Ribo-Zero +模块，用于单管消耗来自多个物种的丰富转录本 | 用于全转录组测序研究。总RNA版本消耗细胞质rRNA，而总RNA金版本消耗细胞质和线粒体rRNA。 | 用于血液来源RNA的全转录组测序研究。耗尽细胞质和线粒体rRNA加上珠蛋白mRNA。 |
| 实践时间 | < 3小时 | 5.5小时 | |
| 输入数量 | 1- 1000ng总RNA为标准质量的RNA样本。建议总RNA最低为10ng，以获得最佳性能和FFPE样品 | 0.1 - 1ug高质量总RNA。质量较低的样本可能需要进一步优化。 | 0.1 - 1ug血液中高质量纯化总RNA |
| 作用机制 | 酶促rRNA消耗，基于连接的适配器和指标的添加 | 珠基rRNA缺失，cDNA合成和PCR | 珠基rRNA缺失，cDNA合成和PCR |
| 方法 | Whole-Transcriptome测序 | Whole-Transcriptome测序 | Whole-Transcriptome测序 |
| 多路复用 | 最多384个唯一双索引(udi) | 低通量试剂盒:最多12个样品。高通量试剂盒:使用组合双指标或唯一双指标制备96个指标样本(即将推出) | 高通量试剂盒:使用组合双指标或唯一双指标(即将推出)制备96个指标样本，低通量试剂盒:最多可池12个样本。或者将24个样本集合A和B放在一起 |
| 物种分类 | 细菌，人类，老鼠，大鼠，病毒 | 人，老鼠，老鼠 | 人，老鼠，老鼠 |
| 技术 | 测序 | 测序 | 测序 |
前-使用Illumina链总RNA Prep with Ribo-Zero Plus进行多物种核糖耗尽。Illumina strand Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus在单管反应中有效地消耗人类，小鼠，大鼠和细菌物种的rRNA水平。将结果与TruSeq链总RNA与Ribo-Zero Gold配对用于哺乳动物物种，与Ribo-Zero细菌用于大肠杆菌(枯草芽孢杆菌数据未显示)进行比较。底-使用Illumina搁浅总RNA Prep with Ribo-Zero Plus从人外周血白细胞中清除球蛋白mRNA
Illumina链总RNA Prep在输入水平为100 ng和10 ng时，为(A)高质量和合成降解的UHR RNA (RIN=2)和(B) FFPE RNA提供高覆盖均匀性。FFPE样品DV200质量评分为55%。所有文库在NovaSeq 6000系统上以50M读取进行测序。使用BaseSpace RNA-Seq Alignment App v2.0.1进行数据分析。
前-性能指标的比较-将Illumina blockchain Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus与TruSeq strand Total RNA with Ribo-Zero进行比较。Illumina strand Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus更有效，特别是在低输入10 ng和1 ng总UHR RNA时。文库在NextSeq 550系统上测序，下采样到30M reads。通过子采样到4M reads计算重复百分比，并使用BaseSpace RNA-Seq Alignment App v2.0进行分析。底- Illumina链全RNA Prep与Ribo-Zero Plus的性能指标
Illumina链总RNA Prep在(A)输入量为1 ng和100 ng UHR RNA和(B)技术复制量为10 ng FFPE RNA之间实现了高数据一致性。文库在NovaSeq 6000系统上按2 × 74 bp进行测序。使用BaseSpace RNA-Seq Alignment App v2.0.1进行数据分析。
Illumina搁浅总RNA Prep提供了一个快速的工作流程，减少了操作时间。时间可能会根据所使用的设备、处理的样品数量、自动化程序或用户体验而有所不同。
