从总RNA中生成以mrna为重点的测序文库,具有增强的多路复用能力和使用主混合试剂的简单工作流程。
试剂盒具有24个独特的指标,提供增强的多路复用性能,处理大量的样品。试剂盒包括包含唯一索引序列的适配器,在文库构建过程开始时连接到样本片段。这使得样品可以被汇集起来,然后在下游分析期间单独识别。
与以前的方法相比,主混合试剂消除了大部分移液步骤,减少了清理量,最大限度地减少了动手时间。这导致经济,高通量RNA测序研究实现了一个用户友好的工作流程。
仪器 | 推荐样本数量 | 读取长度 |
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NextSeq 550系统 | RNA分析:每次运行13-40个样本(基于每个样本1000万次读取) 转录组分析:每组5-16个样本(基于每个样本2500万次读取) |
2 x 75 bp |
HiSeq 2500系统 | RNA分析:每次运行60-400个样品(双流式细胞;基于每个样本1000万次阅读) 转录组分析:每组24-160个样本(双流式细胞;基于每个样本2500万次阅读) |
2 x 75 bp |
TruSeq RNA文库准备试剂盒v2 | TruSeq搁浅mRNA | TruSeq RNA外显子组 | |
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试验时间 | ~ 10.5小时 | ~ 10.5小时 | ~ 2天 |
内容规范 | 捕获编码转录组(没有链信息) | 捕获带有链信息的编码转录组 | 捕获编码转录组/RNA外显子组 |
描述 | 编码转录组分析的一种简单,成本效益高的研究解决方案。 | 为研究人员提供了一个清晰,全面的编码转录组与精确的链信息。 | 通过精确的链信息和减少样本输入要求,为研究人员提供了编码转录组的清晰、全面的视图。 |
实践时间 | ~ 4.5小时 | ~ 4.5小时 | ~ 11个小时 |
输入数量 | 0.1 - 1ug总RNA或10 - 400ng先前分离的mRNA(来自有polyA尾巴的物种) | 0.1 - 1ug总RNA或10 - 100ng先前分离的mRNA(来自有polyA尾巴的物种) | 从新鲜/冷冻样品中提取10 ng总RNA,或从FFPE样品中提取20 ng总RNA |
作用机制 | Oligo-dT珠捕获polyA尾巴 | Oligo-dT珠捕获polyA尾巴 | 靶向编码RNA的生物素化捕获探针。不需要有poly-A尾的RNA。 |
方法 | 信使rna序列 | 信使rna序列 | 外显子组测序,信使rna序列 |
多路复用 | 每车道最多24个plex | 1 - 96 | 最多24个单,96个组合(CD)对偶 |
专门的样本类型 | 不是FFPE-Compatible | 不是FFPE-Compatible | FFPE组织,低输入样本 |
物种分类 | 牛,人,哺乳动物,老鼠,大鼠 | 牛,人,哺乳动物,老鼠,大鼠 | 人类 |
链特异性 | Non-Stranded | 被困 | 被困 |