TruSeq滞留mRNA
从mRNA中制备测序文库，用链特异性信息清楚地了解编码转录组。阅读更多...
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索引适配器
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以前称为Truseq链载mRNA文库预备套件（CAT。No. RS-122-2101，RS-122-2102和RS-122-2103）的产物现在被称为Truseq Slarded mRNA。产品配置已更改。在新配置中，图书馆准备和索引适配器可以单独购买。可以在“选择产品”部分中找到可用于个人购买的组件列表。
Truseq Stranded MRNA提供了一种用于编码转录组分析的简化，成本效益和可扩展的解决方案。它与各种样品兼容。
获得MRNA链取向的精确测量，用于检测反义转录，增强的转录作用作用以及增加的对准效率。高覆盖均匀性增强了诸如替代转录物，基因融合和等位基因特异性表达的特征的发现。
链信息是指从两条DNA链中的哪一条衍生出一个给定的RNA转录本。这些信息增加了文本注释的可信度，特别是对于非人类样本。识别链起源可以增加序列对齐的百分比，降低每个样本的测序成本。
工作流程可实现对标准和低质量样本的强大询问，以及与各种研究设计兼容的工作流程。
| 仪器 | 推荐样本数量 | 读取长度 |
|---|---|---|
| NextSeq 550系统 | RNA分析:每次运行13-40个样本(基于每个样本1000万次读取) 转录组分析：每次运行5-16个样品（基于每个样本的2500万读数） |
2 x 75 bp 2 x 75 bp |
| Hiseq 2500系统 | RNA分析：每次运行60-400个样本（双流量细胞;基于每种样本的1000万读数） 转录组分析:每组24-160个样本(双流式细胞;基于每个示例的2500万次读取) |
2 x 75 bp 2 x 75 bp |
| NovaSeq 6000系统 | RNA分析(每次取样，双流式细胞):S1: 320, S2:384, S4:768。受索引组合(dual)限制。基于1000万次读取。 转录组分析(每批样本，双流式细胞):S1: 128, S2: 256, S4: 768。受索引组合(dual)限制。根据两千五百万次读取。 |
≤2 × 100bp ≤2 × 100bp |
| TruSeq滞留mRNA | TruSeq RNA Library Prep Kit v2 | Truseq RNA Exome. | SureCell WTA 3 ' Library Prep Kit for the ddSEQ System | |
|---|---|---|---|---|
| 试验时间 | 〜10.5小时 | 〜10.5小时 | ~ 2天 | 11 - 12个小时 |
| 内容规范 | 将编码转录组捕获与股线信息 | 捕获编码转录组（没有STRAND信息） | 捕获编码转录组/RNA外显子组 | 捕获编码转录组(3'富集)，具有链特异性信息 |
| 描述 | 为研究人员提供了一种清晰，综合的编码转录组，具有精确的股线信息。 | 一种简单，经济高效的研究解决方案，用于分析编码转录组。 | 使研究人员对编码转录组有一个清晰、全面的看法，精确的链信息和减少样本输入的要求。 | 使单细胞RNA-Seq研究使用液滴发生器分离~1200个细胞每个墨盒，和一个简单的文库准备过程。 |
| 实践时间 | 〜4.5小时 | 〜4.5小时 | 〜11小时 | 4-5小时 |
| 输入数量 | 0.1 - 1 ug总RNA或10-100ng先前分离的mRNA（来自含有Polya Teats的物种） | 0.1 - 1 ug总RNA或10-400ng先前分离的mRNA（来自含有Polya Teats的物种） | 新鲜/冷冻样本总RNA 10ng，或FFPE样本总RNA 20ng | 〜45,000个电池电池（所需输入） |
| 行动机制 | oligo-dt珠捕获Polya尾巴 | oligo-dt珠捕获Polya尾巴 | 靶向RNA的生物素化捕获探针。不需要带有聚尾巴的RNA。 | Oligo DT捕获，单细胞 |
| 方法 | 信使rna序列 | 信使rna序列 | 外显子组测序，信使rna序列 | 信使rna序列 |
| 多路复用 | 1-96 | 每个车道最多24-plex | 最多24个单身，96个组合（CD）双重 | - 24 |
| 专门的样品类型 | 不是FFPE-Compatible | 不是FFPE-Compatible | FFPE组织，低输入样本 | 不ffpe兼容，单细胞 |
| 物种分类 | 牛，人，哺乳动物，老鼠，大鼠 | 牛，人，哺乳动物，老鼠，大鼠 | 人类 | 人类,老鼠 |
| Strand特异性 | 搁浅 | Non-Stranded | 搁浅 | 搁浅 |
图2 from TruSeq strand mRNA and Total RNA Library Prep Kits Data Sheet, December 2015
FFPE组织的技术复制显示高一致性，表明强大的文库制备性能。轴是log2 (FPKM)。R2值显示。
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