以前称为Truseq链载mRNA文库预备套件(CAT。No. RS-122-2101,RS-122-2102和RS-122-2103)的产物现在被称为Truseq Slarded mRNA。产品配置已更改。在新配置中,图书馆准备和索引适配器可以单独购买。可以在“选择产品”部分中找到可用于个人购买的组件列表。
Truseq Stranded MRNA提供了一种用于编码转录组分析的简化,成本效益和可扩展的解决方案。它与各种样品兼容。
获得MRNA链取向的精确测量,用于检测反义转录,增强的转录作用作用以及增加的对准效率。高覆盖均匀性增强了诸如替代转录物,基因融合和等位基因特异性表达的特征的发现。
链信息是指从两条DNA链中的哪一条衍生出一个给定的RNA转录本。这些信息增加了文本注释的可信度,特别是对于非人类样本。识别链起源可以增加序列对齐的百分比,降低每个样本的测序成本。
工作流程可实现对标准和低质量样本的强大询问,以及与各种研究设计兼容的工作流程。
仪器 | 推荐样本数量 | 读取长度 |
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NextSeq 550系统 | RNA分析:每次运行13-40个样本(基于每个样本1000万次读取) 转录组分析:每次运行5-16个样品(基于每个样本的2500万读数) |
2 x 75 bp 2 x 75 bp |
Hiseq 2500系统 | RNA分析:每次运行60-400个样本(双流量细胞;基于每种样本的1000万读数) 转录组分析:每组24-160个样本(双流式细胞;基于每个示例的2500万次读取) |
2 x 75 bp 2 x 75 bp |
NovaSeq 6000系统 | RNA分析(每次取样,双流式细胞):S1: 320, S2:384, S4:768。受索引组合(dual)限制。基于1000万次读取。 转录组分析(每批样本,双流式细胞):S1: 128, S2: 256, S4: 768。受索引组合(dual)限制。根据两千五百万次读取。 |
≤2 × 100bp ≤2 × 100bp |
TruSeq滞留mRNA | TruSeq RNA Library Prep Kit v2 | Truseq RNA Exome. | SureCell WTA 3 ' Library Prep Kit for the ddSEQ System | |
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试验时间 | 〜10.5小时 | 〜10.5小时 | ~ 2天 | 11 - 12个小时 |
内容规范 | 将编码转录组捕获与股线信息 | 捕获编码转录组(没有STRAND信息) | 捕获编码转录组/RNA外显子组 | 捕获编码转录组(3'富集),具有链特异性信息 |
描述 | 为研究人员提供了一种清晰,综合的编码转录组,具有精确的股线信息。 | 一种简单,经济高效的研究解决方案,用于分析编码转录组。 | 使研究人员对编码转录组有一个清晰、全面的看法,精确的链信息和减少样本输入的要求。 | 使单细胞RNA-Seq研究使用液滴发生器分离~1200个细胞每个墨盒,和一个简单的文库准备过程。 |
实践时间 | 〜4.5小时 | 〜4.5小时 | 〜11小时 | 4-5小时 |
输入数量 | 0.1 - 1 ug总RNA或10-100ng先前分离的mRNA(来自含有Polya Teats的物种) | 0.1 - 1 ug总RNA或10-400ng先前分离的mRNA(来自含有Polya Teats的物种) | 新鲜/冷冻样本总RNA 10ng,或FFPE样本总RNA 20ng | 〜45,000个电池电池(所需输入) |
行动机制 | oligo-dt珠捕获Polya尾巴 | oligo-dt珠捕获Polya尾巴 | 靶向RNA的生物素化捕获探针。不需要带有聚尾巴的RNA。 | Oligo DT捕获,单细胞 |
方法 | 信使rna序列 | 信使rna序列 | 外显子组测序,信使rna序列 | 信使rna序列 |
多路复用 | 1-96 | 每个车道最多24-plex | 最多24个单身,96个组合(CD)双重 | - 24 |
专门的样品类型 | 不是FFPE-Compatible | 不是FFPE-Compatible | FFPE组织,低输入样本 | 不ffpe兼容,单细胞 |
物种分类 | 牛,人,哺乳动物,老鼠,大鼠 | 牛,人,哺乳动物,老鼠,大鼠 | 人类 | 人类,老鼠 |
Strand特异性 | 搁浅 | Non-Stranded | 搁浅 | 搁浅 |
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