TruSeq总RNA链
一个健壮的、高度可伸缩的whole-transcriptome分析(RNA-Seq)解决方案和样本类型为各种不同的物种,包括人类,老鼠和formalin-fixed石蜡包埋组织(FFPE)。阅读更多…
图书馆准备
指数适配器
总:
之前的产品被称为TruSeq困总RNA图书馆准备工具包Ribo-Zero人类/鼠标/鼠(猫。不。rs - 122 - 2201, rs - 122 - 2202,和rs - 122 - 2203)和TruSeq总RNA链库与Ribo-Zero黄金准备工具包(猫。不。rs - 122 - 2301, rs - 122 - 2302,和rs - 122 - 2303)现在被称为TruSeq困总RNA人类/鼠标/鼠和TruSeq总RNA链金,分别。产品配置已经改变了。在新配置,图书馆准备试剂和索引适配器可以单独购买。个人购买的可用的组件列表中可以找到“选择产品(s)”部分。
TruSeq总RNA链提供了一个清晰的观点与流线型的转录组,有成本效益的和可伸缩解决方案总RNA与测序分析。
兼容多种样品,包括低质量的DNA / RNA和formalin-fixed,石蜡包埋(FFPE)样品,TruSeq困总RNA夫妇的所有好处TruSeq RNA技术与Ribo-Zero核糖体RNA减少化学。产品使我们能够分析编码和多种形式的非编码RNA的精确测量链取向,均匀覆盖,和高信任度发现的特性,比如替代成绩单、基因融合,allele-specific表达式。
TruSeq困总RNA是专为人类,老鼠和老鼠序列,但可能适用于各种真核物种。
TruSeq总RNA链有多个版本,以适应具体的研究设计需求:
| 仪器 | 推荐的样品数量 | 读取长度 |
|---|---|---|
| NextSeq 550系统 | RNA分析:6 20样品每运行(基于2000万读/样本) 转录组分析:2 - 8每运行样本(基于5000万读/样本) |
2 x 75个基点 |
| HiSeq 2500系统 | RNA分析:30 - 200样本/运行(双流细胞;基于2000万读/样本) 转录组分析:12 - 80样本/运行(双流细胞;基于5000万读/样本) |
2 x 75个基点 |
| NovaSeq 6000系统 | RNA分析(每运行样本,双流动池):S1: 160年,S2: 320年,S4: 768。受限于指数组合(双)。根据2000万年的读取。 转录组分析(每运行样本,双流动池):S1: 64年,S2: 128年,S4: 400。受限于指数组合(双)。根据5000万年的读取。 |
≤2×100个基点 |
| TruSeq总RNA链 | TruSeq Ribo-Zero球蛋白链总RNA | |
|---|---|---|
| 内容规范 | 捕捉编码RNA +多种形式的非编码RNA | 捕捉编码RNA +多种形式的非编码RNA |
| 描述 | whole-transcriptome测序研究。总RNA版本耗尽细胞质核糖体RNA而总RNA黄金版本耗尽细胞质和线粒体核糖体RNA。 | whole-transcriptome测序研究血液的RNA。耗尽细胞质和线粒体核糖体rna +球蛋白信使rna。 |
| 输入数量 | 0.1 - 1 ug高质量的总RNA。低质量的样本可能需要进一步优化。 | 0.1 - 1 ug高质量的净化血液的总RNA |
| 方法 | Whole-Transcriptome测序 | Whole-Transcriptome测序 |
| 专门的样本类型 | FFPE组织 | 血 |
| 物种分类 | 人类,老鼠,老鼠 | 人类,老鼠,老鼠 |
BaseSpace序列中心SRA提交应用程序启用跟踪样品,从图书馆准备到数据分析,帮助生物技术资源中心测序核心(BRC-Seq)英属哥伦比亚大学的交付高质量测序数据和额外的价值客户。
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