使用Infinium MethylationEPIC BeadChip试剂盒,研究人员可以在单核苷酸分辨率上定量询问基因组上超过85万个甲基化位点。多个样本(包括FFPE)可以并行分析,以提供高吞吐量的功率,同时最小化每个样本的成本。
Infinium HD阵列技术使内容选择独立于通常与甲基化DNA捕获方法相关的偏置相关限制。结果是甲虫的泛增强剂和编码区域视图,可用于对各种人组织的外血桂聚烯酶 - 宽协会研究。
此套件包括甲基化专家要求的内容类别,例如:
MethylationEPIC数据分析由GenomeStudio Methylation Module支持。GenomeStudio软件使研究人员能够轻松地对小规模研究进行差异甲基化分析。它具有先进的可视化工具,使研究人员能够在单个图表中查看大量数据,如热图、散点图和线图。
这些工具和GenomeStudio Genome Browser显示有价值的信息,如染色体坐标、GC百分比、CpG岛的位置和甲基化β值。
对于大规模的研究,在软件框架R中有许多免费的分析包,用于标准化和甲基化数据的差异分析。教学视频解释这些数据分析包的使用。
英飞纳姆MethylationEPIC工具包 | TruSeq甲基捕获史诗库准备试剂盒 | |
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内容规范 | 850000年论文认定的目标。定量地询问整个基因组中选择的甲基化位点。 | 目标超过330万cpg。询问生物学上重要的甲基组目标。 |
描述 | 定量询问整个基因组中选择的甲基化位点,以最低的成本提供高通量研究能力。 | 对一组甲基组靶点进行重点询问,寻找一种平衡的、具有成本效益的选择,可以支持筛查研究和生物标志物发现研究目标。 |
输入数量 | 250 ng DNA | 500ng人类基因组DNA |
方法 | 甲基化数组 | 甲基化测序,有针对性的DNA测序 |
样本数量 | 每个阵列8个样本 | 最多12-plex |
专门的样品类型 | FFPE组织,低输入样本 | 不是FFPE-Compatible |
物种类别 | 人类 | 人类 |
技术 | 微阵列 | 测序 |
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使用安捷伦Bravo液体处理平台的Illumina Truseq Exome Entich的自动化
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Infinium甲基化型试剂盒是人甲基化450珠芯片试剂盒的推荐替代产品,其已停止。Illumina仍然致力于为您提供高质量的支持和服务。