核糖体RNA的损耗(rRNA)之前RNA序列(RNA-Seq)使研究人员专注于分析转录组的高附加值部分。Illumina公司rRNA删除解决方案设置标准rRNA和球蛋白mRNA损耗RNA-Seq图书馆准备。
核糖体rna损耗过程:
| RNA样本 | 停止包 | 建议更换 | 删除Euk。细胞质核糖体rna | 删除线粒体核糖体rna | 去除细菌核糖体rna | 删除叶绿体核糖体rna | 删除球蛋白mRNA |
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| 人类和其他动物物种和FFPE RNA | Ribo-Zero rRNA移除工具(人/鼠标/鼠) | TruSeq困总RNA图书馆准备人力/鼠标/老鼠 | ✓ | ||||
| 人类和其他动物物种;FFPE RNA | Ribo-Zero黄金rRNA移除工具(人/鼠标/鼠) | TruSeq困总RNA黄金 | ✓ | ✓ | |||
| 人类微生物组和其他bacteria-infected人类,老鼠,老鼠样本 | Ribo-Zero黄金rRNA去除工具包(流行病学) | 可选择的解决方案待定 | ✓ | ✓ | ✓ | ||
| 细菌 (革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌的种群混合) |
Ribo-Zero rRNA去除工具包(细菌) | 新产品待定,请联系技术支持 | ✓ | ||||
| 革兰氏阴性细菌 | Ribo-Zero rRNA去除工具包(革兰氏阴性菌) | 新产品待定,请联系技术支持 | ✓ | ||||
| 革兰氏阳性细菌 | Ribo-Zero rRNA移除工具(革兰氏阳性细菌) | 新产品待定,请联系技术支持 | ✓ | ||||
| 植物叶组织 | Ribo-Zero rRNA去除工具包(植物叶) | 新产品待定,请联系技术支持 | ✓ | ✓ | ✓ | ||
| 植物种子或根组织 | Ribo-Zero rRNA移除工具(植物种子/根) | TruSeq滞留图书馆准备植物总RNA | ✓ | ✓ | ✓ | ||
| 哺乳动物血液RNA | Globin-Zero黄金装备 | TruSeq Ribo-Zero球蛋白链总RNA | ✓ | ✓ | ✓ | ||
| 酵母 | Ribo-Zero rRNA去除工具包(酵母) | 没有替代方案 | ✓ | ✓ |
| 样本类型 | 停止包 | 建议更换 | 输入RNA (ScriptSeq) | 评论(ScriptSeq) |
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| 保利(A)二十三或rRNA-depleted RNA(用户提供)从任何来源,包括FFPE组织 | ScriptSeq v2 RNA-Seq图书馆准备装备 | TruSeq滞留mRNA | 500 pg - 50 ng保利(A)二十三或rRNA-depleted RNA(用户提供) | 不包括Ribo-Zero rRNA或Globin-Zero球蛋白mRNA删除工具。需要故障保险PCR酶混合(用户提供)。 |
| 人类/鼠标/老鼠和其他高等脊椎动物;FFPE RNA | ScriptSeq完成黄金装备(人/鼠标/鼠) | TruSeq总RNA链 | 1 - 5µg总RNA | 包括除Ribo-Zero rRNA工具包和ScriptSeq图书馆准备装备。需要故障保险PCR酶混合(用户提供)。 |
| 血 | ScriptSeq完成黄金装备(血液) | 总RNA球蛋白TruSeq滞留 | 1 - 5µg总RNA | 除包括Globin-Zero rRNA /球蛋白mRNA工具包和ScriptSeq图书馆准备装备。需要故障保险PCR酶混合(用户提供)。 |
| 微生物,细菌感染人类/鼠标/老鼠 | ScriptSeq完成黄金装备(流行病学) | 选择可以从其他的供应商 | 500 ng - 2.5µg的总RNA | 包括除Ribo-Zero rRNA工具包和ScriptSeq图书馆准备装备。需要故障保险PCR酶混合(用户提供)。 |
| 细菌 | ScriptSeq完整的工具包(细菌) | 选择可以从其他的供应商 | 1 - 5µg总RNA | 包括除Ribo-Zero rRNA工具包和ScriptSeq图书馆准备装备。需要故障保险PCR酶混合(用户提供)。 |
| 植物叶子上 | ScriptSeq完整的工具包(植物叶) | TruSeq滞留植物总RNA | 1 - 5µg总RNA | 包括除Ribo-Zero rRNA工具包和ScriptSeq图书馆准备装备。需要故障保险PCR酶混合(用户提供)。 |
| 植物种子或根 | ScriptSeq完整的工具包(植物种子/根) | TruSeq滞留植物总RNA | 1 - 5µg总RNA | 包括除Ribo-Zero rRNA工具包和ScriptSeq图书馆准备装备。需要故障保险PCR酶混合(用户提供)。 |
| 酵母 | ScriptSeq完成黄金装备(酵母) | 选择可以从其他的供应商 | 100 ng - 5µg的总RNA | 包括除Ribo-Zero rRNA工具包和ScriptSeq图书馆准备装备。需要故障保险PCR酶混合(用户提供)。 |