TruSeq困总RNA是专为人类,老鼠,老鼠和植物序列,但可能适用于各种真核物种。下面的表列出生物实验室的测试和由Illumina公司完全支持,在网上测试,或者报道工作由我们的客户。Illumina公司不能保证rRNA去除根据客户报告的结果。
如果未列出您感兴趣的物种,接触Illumina公司技术支持生物的核糖体rna序列的选择。我们可以执行一个在网上评估,以帮助确定如果你的生物兼容TruSeq链总RNA工具包。由于我们执行在网上设计评估,Illumina公司不能保证rRNA移除。
生物 | 实验室测试 | 在网上测试 | 客户报告 | 评论 |
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蜜蜂(的蜜蜂) | 尽可能使用高质量RNA。 | |||
鸡(背带吊裤带) | 删除5 s, 18岁和28 s rrna。线粒体核糖体rna不测试。 | |||
Ciona intestinalis | 删除18 s rRNA。其他核糖体rna不测试。 | |||
炭疽菌higginsianum | 将删除5.8 28 s和s rRNA。不会删除5 s rRNA。18 s rRNA不评估。 | |||
桡脚类动物的物种 | 删除28 s和18 s rrna。其他核糖体rna没有评估。 | |||
牛 | ||||
盘基网柄菌discoideum | 删除28 s和18 s rRNA从高质量的RNA。不会删除小核糖体rna。 | |||
狗 | ||||
雪貂(Mustela putorius) | ||||
雀(Carpodacus mexicanus) | 删除5 s和18 s rRNA。不会删除18 s rRNA。线粒体核糖体rna不测试。 | |||
面粉甲虫(种有害castaneum) | ||||
青蛙(非洲爪蟾蜍) | ||||
果蝇(果蝇) | 不会删除5 s rRNA或28 s rRNA的“正确”的片段。 | |||
真菌(黑曲霉) | 300元地区18 s rRNA不会从退化的样本。尽可能使用高质量RNA。 | |||
真菌(担子菌类) | 尽可能使用高质量RNA。 | |||
真菌(白色念珠菌) | ||||
真菌(新型隐球菌) | 不会删除5.8或5 s rrna。尽可能使用高质量RNA。 | |||
真菌(Yarrowia lipolytica) | 不会删除5.8或5 s rrna。尽可能使用高质量RNA。 | |||
马(马) | ||||
人类 | 所有组织除了血液;使用TruSeq总的rna链Ribo-Zero球蛋白血液样本。 | |||
昆虫(Rhodnius prolixus) | 尽可能使用高质量RNA。线粒体核糖体rna不删除。 | |||
七鳃鳗 | 尽可能使用高质量RNA。 | |||
海洋海绵(海甘蓝海甘蓝) | 尽可能使用高质量RNA。 | |||
猴子(短尾猿;猕猴猕猴) | ||||
猴子(非洲绿;Chlorocebus sabaeus) | ||||
猴子(恒河猴;解剖) | ||||
蚊子(冈比亚疟蚊) | 删除18 s rRNA。不会删除5 s, 5.8年代,和12个年代,线粒体16 s rRNA。28 s rRNA不测试。 | |||
鼠标 | 所有组织除了血液;使用TruSeq总的rna链Ribo-Zero球蛋白血液样本。 | |||
线虫(秀丽隐杆线虫) | 尽可能使用高质量RNA。 | |||
纽特(Notophthalmus viridescens) | 不得删除5.8或5 s rrna。尽可能使用高质量RNA。 | |||
恶性疟原虫 | 不会删除5.8或5 s rrna。尽可能使用高质量RNA。 | |||
Poeciliid鱼 | 删除28 s和18 s rRNA。不能删除所有5 s rRNA。 | |||
老鼠 | 所有组织除了血液;使用TruSeq总的rna链Ribo-Zero球蛋白血液样本。 | |||
大马哈鱼(大西洋鲑) | 删除了18岁,5.8年代,5 s rrna。不会删除28 s rRNA。线粒体核糖体rna没有评估。 | |||
海葵(Nematostella vectensis) | 尽可能使用高质量RNA。 | |||
猪 | 删除28 s, 18岁,5.8年代和5 s rrna。 | |||
刚地弓形虫 | 使用高质量的RNA。 | |||
锥虫属brucei | 将删除28 s和18 s rRNA。其他rRNA没有评估。 | |||
大葱(葱属植物fistulosum) | 删除18 s rRNA。其他核糖体rna不测试。 | |||
斑马鱼(鲐鱼类) |
生物 | 实验室测试 | 在网上测试 | 客户报告 | 评论 |
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人类 | 血液样本;对于所有其他组织使用TruSeq总的rna链Ribo-Zero人类/鼠标/鼠或TruSeq总的rna链Ribo-Zero黄金 | |||
鼠标 | 血液样本;对于所有其他组织使用TruSeq总的rna链Ribo-Zero人类/鼠标/鼠或TruSeq总的rna链Ribo-Zero黄金 | |||
老鼠 | 血液样本;对于所有其他组织使用TruSeq总的rna链Ribo-Zero人类/鼠标/鼠或TruSeq总的rna链Ribo-Zero黄金 |
生物 | 实验室测试 | 在网上测试 | 客户报告 | 评论 |
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拟南芥 | 兼容的叶子、种子和根。 | |||
鹰嘴豆(中投arietinum) | 删除4.5 s, 16 s, 23 s叶绿体核糖体rna和18 s细胞质核糖体rna。不会删除5 s叶绿体和细胞质核糖体rna的5 s。其他核糖体rna不测试。 | |||
玉米 | 兼容的叶子、种子和根。 | |||
棉花 | ||||
真核绿藻(衣藻) | 尽可能使用高质量RNA。 | |||
小道消息 | ||||
日本忍冬(金银花粳稻) | ||||
玉米 | 兼容的叶子、种子和根。 | |||
布什的镜子(Coprosma被) | ||||
莫斯(Physcomitrella) | ||||
Prorocentrum最低 | 删除18岁和28 s rRNA。其他核糖体rna不测试。 | |||
大米 | 兼容的叶子、种子和根。 | |||
大豆 | 兼容的叶子、种子和根。 | |||
番茄(茄属植物lycopersicum) | ||||
越南香菜(红脚鹬odorata) | ||||
水三叶草(Marsilea vistita) | ||||
大葱 | 尽可能使用高质量RNA。 | |||
小麦 | 兼容的叶子、种子和根。 |
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