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TruSeq困总RNA生物兼容性

生物兼容性的细节

TruSeq困总RNA是专为人类,老鼠,老鼠和植物序列,但可能适用于各种真核物种。下面的表列出生物实验室的测试和由Illumina公司完全支持,在网上测试,或者报道工作由我们的客户。Illumina公司不能保证rRNA去除根据客户报告的结果。

如果未列出您感兴趣的物种,接触Illumina公司技术支持生物的核糖体rna序列的选择。我们可以执行一个在网上评估,以帮助确定如果你的生物兼容TruSeq链总RNA工具包。由于我们执行在网上设计评估,Illumina公司不能保证rRNA移除。

RNA序列的好处

RNA-Seq使用新一代测序分析表达式在转录组,使研究人员能够检测已知或小说的特性和量化RNA。

亚博官网人口
TruSeq总的rna链Ribo-Zero人类/鼠标/老鼠
TruSeq总的rna链Ribo-Zero黄金
生物 实验室测试 在网上测试 客户报告 评论
蜜蜂(的蜜蜂) 尽可能使用高质量RNA。
(背带吊裤带) 删除5 s, 18岁和28 s rrna。线粒体核糖体rna不测试。
Ciona intestinalis 删除18 s rRNA。其他核糖体rna不测试。
炭疽菌higginsianum 将删除5.8 28 s和s rRNA。不会删除5 s rRNA。18 s rRNA不评估。
桡脚类动物的物种 删除28 s和18 s rrna。其他核糖体rna没有评估。
盘基网柄菌discoideum 删除28 s和18 s rRNA从高质量的RNA。不会删除小核糖体rna。
雪貂(Mustela putorius)
(Carpodacus mexicanus) 删除5 s和18 s rRNA。不会删除18 s rRNA。线粒体核糖体rna不测试。
面粉甲虫(种有害castaneum)
青蛙(非洲爪蟾蜍)
果蝇(果蝇) 不会删除5 s rRNA或28 s rRNA的“正确”的片段。
真菌(黑曲霉) 300元地区18 s rRNA不会从退化的样本。尽可能使用高质量RNA。
真菌(担子菌类) 尽可能使用高质量RNA。
真菌(白色念珠菌)
真菌(新型隐球菌) 不会删除5.8或5 s rrna。尽可能使用高质量RNA。
真菌(Yarrowia lipolytica) 不会删除5.8或5 s rrna。尽可能使用高质量RNA。
()
人类 所有组织除了血液;使用TruSeq总的rna链Ribo-Zero球蛋白血液样本。
昆虫(Rhodnius prolixus) 尽可能使用高质量RNA。线粒体核糖体rna不删除。
七鳃鳗 尽可能使用高质量RNA。
海洋海绵(海甘蓝海甘蓝) 尽可能使用高质量RNA。
猴子(短尾猿;猕猴猕猴)
猴子(非洲绿;Chlorocebus sabaeus)
猴子(恒河猴;解剖)
蚊子(冈比亚疟蚊) 删除18 s rRNA。不会删除5 s, 5.8年代,和12个年代,线粒体16 s rRNA。28 s rRNA不测试。
鼠标 所有组织除了血液;使用TruSeq总的rna链Ribo-Zero球蛋白血液样本。
线虫(秀丽隐杆线虫) 尽可能使用高质量RNA。
纽特(Notophthalmus viridescens) 不得删除5.8或5 s rrna。尽可能使用高质量RNA。
恶性疟原虫 不会删除5.8或5 s rrna。尽可能使用高质量RNA。
Poeciliid鱼 删除28 s和18 s rRNA。不能删除所有5 s rRNA。
老鼠 所有组织除了血液;使用TruSeq总的rna链Ribo-Zero球蛋白血液样本。
大马哈鱼(大西洋鲑) 删除了18岁,5.8年代,5 s rrna。不会删除28 s rRNA。线粒体核糖体rna没有评估。
海葵(Nematostella vectensis) 尽可能使用高质量RNA。
删除28 s, 18岁,5.8年代和5 s rrna。
刚地弓形虫 使用高质量的RNA。
锥虫属brucei 将删除28 s和18 s rRNA。其他rRNA没有评估。
大葱(葱属植物fistulosum) 删除18 s rRNA。其他核糖体rna不测试。
斑马鱼(鲐鱼类)

TruSeq总的rna链Ribo-Zero球蛋白
生物 实验室测试 在网上测试 客户报告 评论
人类 血液样本;对于所有其他组织使用TruSeq总的rna链Ribo-Zero人类/鼠标/鼠或TruSeq总的rna链Ribo-Zero黄金
鼠标 血液样本;对于所有其他组织使用TruSeq总的rna链Ribo-Zero人类/鼠标/鼠或TruSeq总的rna链Ribo-Zero黄金
老鼠 血液样本;对于所有其他组织使用TruSeq总的rna链Ribo-Zero人类/鼠标/鼠或TruSeq总的rna链Ribo-Zero黄金

TruSeq总的rna链Ribo-Zero植物
生物 实验室测试 在网上测试 客户报告 评论
拟南芥 兼容的叶子、种子和根。
鹰嘴豆(中投arietinum) 删除4.5 s, 16 s, 23 s叶绿体核糖体rna和18 s细胞质核糖体rna。不会删除5 s叶绿体和细胞质核糖体rna的5 s。其他核糖体rna不测试。
玉米 兼容的叶子、种子和根。
棉花
真核绿藻(衣藻) 尽可能使用高质量RNA。
小道消息
日本忍冬(金银花粳稻)
玉米 兼容的叶子、种子和根。
布什的镜子(Coprosma被)
莫斯(Physcomitrella)
Prorocentrum最低 删除18岁和28 s rRNA。其他核糖体rna不测试。
大米 兼容的叶子、种子和根。
大豆 兼容的叶子、种子和根。
番茄(茄属植物lycopersicum)
越南香菜(红脚鹬odorata)
水三叶草(Marsilea vistita)
大葱 尽可能使用高质量RNA。
小麦 兼容的叶子、种子和根。

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