澳大利亚基因组学中心将其服务缩放，以与全球的研究人员合作
较低的NovaSeq 6000系统排序成本激发了新项目和客户增长。
澳大利亚基因组学中心将其服务缩放，以与全球的研究人员合作
总结
概述
迪肯基因组中心要提供和执行更大，更雄心勃勃的测序项目。
挑战
寻找高通量NGS系统，可以扩展较大的测序项目，并支持不同的应用。
解决方案
Chris Austin教授和他的团队选择了Novaseq 6000系统。
好处
Novaseq 6000系统正在支持Dakin University Research和中心作为基因组学枢纽的增长，吸引了国际合作者的兴趣。
介绍
Chris Austin博士于2017年末成立了迪肯基因组学中心。1起初，它有一个MiSeq™系统来支持测序项目。MiSeq系统最初用于微生物测序和浅层基因组测序。很快，迪肯基因组中心收到了更大、更雄心勃勃的项目的请求，超出了MiSeq系统的能力。他们开始将测序外包给HiSeq™Systems的服务提供商。虽然数据质量很好，但这是一个昂贵的选择，周转时间很长。
奥斯汀教授说:“我们意识到，最好购买一个高通量下一代测序(NGS)系统，它可以扩大规模，用于更大的测序项目。”“我们还需要一个系统，可以支持多种应用，包括靶向、全基因组测序(WGS)、全外显子测序(WES)和RNA-Seq。我们得到了Illumina公司MiSeq系统的良好支持。这让我们有信心选择NovaSeq 6000系统。”
提供超过高吞吐量排序
该NovaSeq 6000系统做得不仅仅是提高在迪肯大学的研究能力。据拉里·克劳馥，基因组学副教授兼经理迪肯基因组中心，“它使我们能够建立NGS到我们的教学计划。今天，我们的本科生和研究生可以进入实验室，并学习如何执行库准备。yobet亚洲他们可能不被按下所有的按钮，却可以看到什么NovaSeq 6000系统能够和了解NGS和基因组学的整体概念。”
NovaSeq 6000系统还支持迪肯基因组学中心作为基因组学中心的发展。”我们拥有澳大利亚主要城市以外唯一的NovaSeq 6000系统，”奥斯汀教授说它已成为迪肯研究人员的宝贵平台，也是吸引国际合作者兴趣和吸引研究合作伙伴的重要资产。除了在基因组学方面与我们合作外，他们还将其学生和员工送往迪肯大学接受培训。这是我们从新基础设施和NovaSeq 6000系统中获益的又一种方式。”
加速在迪肯大学和全球的研究
通过NovaSeq 6000系统，迪肯基因组中心正在进行大规模测序。“我们可以做的不仅仅是基因组组装，”奥斯汀教授补充道。“我们可以同时对数千个不同个体的样本进行WGS，或者进行浅撇测序，以支持选择性繁殖和进化研究。它是多功能的，使我们能够执行RNA-Seq。”
“我们可以同时对数千种不同个体的样本进行WGS或进行浅浏览速度测序以支持选择性育种和进化研究。”
易于使用的系统使新员工学习如何快速操作。yobet亚洲“库准备也快，它的吞吐量是惊人的，‘助理克罗夫特教授说，’再过两天，就可以产生上只是一个流动池近四TB的数据。从理论上讲，我们可以产生8个TB的数据每两天。这是在我们的能力上有重大改变。相反，测序一个基因组，我们可以考虑测序几百甚至基因组的同时1000“。
克罗夫特副教授喜欢该系统提供的同时运行多个项目的灵活性。“我们可以在四个不同的流单元通道上加载许多不同项目的样本，”克罗夫特副教授补充说。“在一次试验中，我们可以用不同片段大小的样本混合进行转录组测序和基因组测序。”
更低的排序成本吸引更多的项目
NovaSeq 6000系统大大降低了迪肯基因组学中心的测序成本。”克罗夫特副教授说：“这激发了使用测序的新可能性。”在拥有NovaSeq 6000系统一年后，我们有90个独立的项目正在进行中。到明年，我们希望有200-300个测序项目。我们还没有达到NovaSeq 6000系统生成数据的能力。我们正在确保我们有实验室基础设施，特别是生物信息学人员来处理这一增长。我们需要一段时间才能脱离NovaSeq 6000系统。
支持新的研究
奥斯汀教授说：“NovaSeq 6000系统创造并支持了许多新的研究机会。我们正在回答重要的问题，并找到关键问题的答案，否则这些问题可能无法解决。没有它，我们的研究将相当平淡。我们将在更小的规模上执行更少的项目。”
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参考：
- 迪肯大学基因组中心。迪肯大学。www.deakin.edu.au/life-environmental-sciences/facilities/deakin-genomics-centre。访问时间2019年4月2日。