一个家族事件:第四代夏萝莱犬拥抱基因组育种
基因分型技术通过使法国农民在出生时就知道他的公牛和母牛的遗传价值，提高了育种选择决策。
一个家族事件:第四代夏萝莱犬拥抱基因组育种
介绍
50多年来，110公顷的Peupliers农业开发集团(GAEC)一直位于南特和昂热之间的卢瓦尔河畔。农场的共同所有人安东尼·查里尔(Antoine Charrier)是第四代养牛人，他有50头荷斯坦牛和50头夏洛来牛。在过去几十年里，农业发生了巨大的变化。这位55岁的农民说:“为了养家，我祖父养了20-30头动物。”“我父母那一代人被期望生产更多一点。今天要养活一个人，我们至少需要50头牛。”
在过去，农民独立工作，为他们的家庭和当地生产粮食。然而，现在对夏洛来农民的要求更高了，他们要比以前生产更多的粮食用于出口。查里尔说:“要养活的人越来越多，农民却越来越少。“所以，我们不得不适应。我们的农场更大，每个农场的牲畜也更多。”
技术的进步，特别是在基因组学领域的进步，现在可以帮助像查里尔这样的农民跟上当今的需求。iccommunity与Charrier谈论了他如何将基因分型信息纳入管理他的牧群的增长。
安东尼·查里尔(Antoine Charrier)是卢瓦尔河畔GAEC des Peupliers农场的共同所有者。
问:你是什么时候开始在你的牧群中使用基因组学的?
安东尼·查里尔(AC):我们第一次把夏洛来奶牛带进农场是在20世纪70年代末，当时我父亲是农场的负责人。当时每个人都有一种当地的品种，叫做la Rouge des Près。然而，这种当地品种有产犊困难，以及其他健康问题。这就是为什么我父亲把第一批夏洛来带到农场。他很快开始使用人工授精来管理象群。他是当地农业合作社的管理员，熟悉当时的最新技术。
即使在那时，人们已经在谈论基因进步，即选择可以纠正某些标准的公牛。我们还担心容易产犊的问题。所以，当我们选择公牛时，我们为小母牛进行了人工授精，以减少产犊的问题。很快，我们发现，高质量的小牛意味着我们可以将这些特征传递给整个牛群，甚至是奶牛。渐渐地，人工授精成了我们耕种的一部分。到20世纪90年代末，整个鹿群都进行了人工授精。
在我们的农场里，好几代奶牛都采用了人工授精技术。在过去的几十年里，我们在农业实践中引入了许多新技术。我们有妊娠测试，这样我们就可以看到奶牛是否怀孕，并使用胚胎移植来增加对大牛的使用30年。现在我们正在使用基因分型，这些数据使我们能够比过去更好地选择我们的公牛。
问:基因分型如何帮助你为牛群选择最好的公牛?
交流:我们过去常常从目录中挑选公牛，在经过一系列不同的测试阶段后，必须等上大约7年才能知道这种动物的遗传价值。我们要等很长时间才能知道我们是否做出了正确的选择。当时，没有其他选择。基因分型使我们获得了近5年的知识，因为我们现在几乎从出生开始就知道公牛的遗传价值。当公牛进入青春期时，我们可以用它来收集受精剂量。我们也可以卖雄性来繁衍后代。
当客户来找我们时，我们可以给他们看牛的基因分型数据。它提供的遗传信息就好像这头公牛已经产下了20头或更多的小牛。它可以立即向农民提供额外的信息，这是人们非常想要的。
“基因分型使我们获得了近5年的知识，因为我们现在几乎从出生开始就知道公牛的遗传价值。”
问:基因分型是否改变了你们的育种标准?
交流:基因分型并没有改变我们的育种标准。然而，它使育种选择过程加快了许多。因为信息丰富，我们对女性的基因分型和对男性的一样多。
对雌性进行基因分型可以让我们很早就知道母牛的遗传价值，特别是因为小母牛在两岁时就有了第一个小牛犊。从一开始，我们就知道小母牛的产犊难易程度或产犊能力。以前，小母牛独自产犊，小牛很小。根据基因分型数据告诉我的情况，我可以将具有容易产犊基因的小母牛与大小合适、基因正确的公牛进行匹配。即使是在很小的时候就开始产犊的牛，产犊容易的数据也是正确的。最终，它使我能够发展一个更强大的群体。
问:基因分型如何使你们能够管理基因异常?
交流:管理基因异常的能力是基因分型的一个显著优势。它使我们能够在我们的兽群中识别遗传疾病携带者。像所有的犬种一样，夏洛来犬种也有自己特定的疾病，包括共济失调，即动物瘫痪;盲症，即动物在4-5岁时失明;还有一种小牛出生时没有牙齿的疾病。我们还可以识别出带有culard基因的动物，该基因与容易产犊有关，以及没有角的基因。
通过基因分型，我们可以及早发现这些问题。当我们卖给饲养者时，我们可以告诉他们，“这只动物有正确版本的culard基因，或者这只动物没有遗传疾病。”这在出售动物时非常有用。
问:对畜群进行基因分型的投资回报是什么?
交流:当每个人都意识到基因分型的价值并使用它时，它对我们所有人都有帮助。能够识别遗传疾病是一个巨大的优势。当人们考虑到这一点时，他们倾向于对基因分型更开放。
基因分型的初始成本可能会让一些农民望而却步，但其价值是存在的。如果你看看我们的农场和育种计划，我们正在测试更多的雄性，并使用基因分型更快更早地识别出最好的雄性。立即了解遗传变异，并确定没有疾病的犊牛，使我们能够迅速提高遗传进展。这对我们的繁殖计划和畜群都很有利。
然而，我们不能用任何老方法进行基因分型。如果我们同意基因组学很重要，我们就需要对动物进行显型研究，即给动物称重，并测量它们的生长情况。
即使我们正在进行基因分型，我们仍然需要不时地查看父母的指数，以确保我们的动物匹配。总的来说，我们发现这些指标和基因分型基本吻合。然而，有些动物的基因分型主要集中在肌肉而不是骨骼上。当我们看到动物在我们面前时，都是关于骨骼结构的质量。
“如果我们同意基因组学很重要，我们就需要对动物进行显型研究，即称体重，并测量它们的生长情况。”
问:您希望在基因分型参数方面看到哪些变化?
交流:基因分型在育种计划中是一个很好的工具，获得更多的信息总是很有用的。我希望看到基因分型发展到包括更多的标准。目前，我们有一个肌肉发育的综合指数，还有一个骨骼发育的指数。当我们看到公牛的骨骼指数很高时，这可能是因为它们的长度，而不一定是因为它们的身高。我的梦想是，遗传学将为我们提供每一项标准的数据，关于骨盆的长度，臀部的宽度，动物的生长，品种的品质，等等。为了使这成为现实，我们需要收集更多的表型数据。
问:你如何看待农业社区提供的表型数据?
交流:农民将需要对他们的牲畜进行更多的测量。我们还没有足够多的农民来监控他们的畜群，这样我们就可以收集这些数据。理想情况下，如果农民有兴趣正确地经营夏洛来牧群，他们将收集数据来为这些指数提供信息。
幸运的是，Charolais Univers正在承担部分工作。它已经启动了一项关于性早熟和生育特征的研究项目。考虑到我们给动物授精的年龄越来越小，我们需要这些关于性成熟和生育能力的指标。夏洛来大学要求农民帮助建立这些指数。动物身上的项圈将收集数据并将其发送到移动基地。这将使我们在未来有关于早熟和生育能力的指数。
夏洛来大学也在对肉的质量进行研究。有了基因分型，我们可以对任何东西都有索引。例如，我们可以通过监测动物称重时的行为，注意它是在移动还是静止，来建立动物行为和脾气的指数。
我们需要明白，我们拥有的指数越多，找到合适的公牛进行交配就越复杂。然而，它仍将为农民提供额外的信息，这对帮助他们提高农业收入很有价值。
问:你希望基因分型在未来能使你取得什么成就?
交流:我的目标是要有一个易于管理的牧群。我想让奶牛在我们的牛群中永久化，以我们的工作谋生，并使我的继任者能够在良好的条件下工作。
我的商业伙伴和我正计划在GAEC des Peupliers雇佣一个年轻人，向有机农业转型。我们希望生产更多、质量更好、但对环境影响更小的食品。这是我们给自己设定的挑战。我相信基因组学将帮助我们沿着这条路走下去。