重新定义发现的代价
自人类基因组计划完成以来，下一代测序(NGS)的成本以惊人的速度下降，超过了摩尔定律。通过不断的创新，Illumina帮助降低了NGS的成本，实现了1000美元的人类基因组。
随着下一代测序成本的持续下降，Illumina在使NGS更便宜和更容易获得方面处于领先地位。我们努力帮助各种规模的实验室利用这一强大技术的潜力。通过这些资源，我们将指导您在规划NGS预算时应考虑的关键因素。
下一代测序成本比较
在评估NGS成本时，考虑您的研究样本量。一般来说，对于在少数样本上仅分析少数（<20）个靶点，传统方法（如Sanger测序或qPCR）是有用的。对于测序超过20个目标区域或高样本量，NGS是首选。
NGS还提供了更高的发现能力和灵敏度，以检测新的或罕见的变异。它提供了一种无假设的方法，不需要序列信息的先验知识。这些见解对于实现发现和推动研究出版物来说是无价的。
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门店与qPCR
NGS与Sanger测序
门店与微阵列
下一代测序成本考虑
当估算NGS的成本时，考虑这些因素：
- 仪器购买
- 每个样品的成本(如DNA分离、文库准备和测序试剂)
- 数据分析与存储
- 可选仪器支撑计划
- 选择性培训和预防性维护
还要考虑额外的实验室设备，如:
- 核酸定量仪
- 核酸质量分析仪
- 热循环器
- 超声波仪（用于某些图书馆准备方法）
- 离心机
- 普通实验室用品（如移液器、96孔板、离心管）
每样NGS成本的例子
| 应用 | 每个样本的估计成本 | 实验参数 |
|---|---|---|
| 靶向基因表达谱 | 23美元 | 每个样本的成本计算是基于运行使用:
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| 16 s宏基因组测序 | 18美元 | 每个样本的成本计算是基于运行使用:
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NGS数据分析成本
NGS数据存储和分析的成本是初学者最常见的问题之一。三个因素将影响您的数据分析预算：
- 授权一个数据分析软件平台
- 存储数据（通常是许可成本的一部分）
- 运行数据分析应用程序（也称为计算成本）
计算成本可能因分析的测序数据量而异。为了帮助您计算研究中NGS数据分析的成本，我们估算了常用方法产生的数据量。
| 应用 | 估计数据输出 |
|---|---|
| 人类全基因组测序(30倍覆盖) | 约120 Gb |
| 人类外显子组测序(100×覆盖范围) | ~ 8 Gb |
| 微生物全基因组测序 | ~ 300 Mb |
| 16 s rRNA测序 | 约60 Mb |
1mb = 1,000,000个碱基
1g (Gb) = 1000,000,000个基数
生成的数据量与您的实验的测序覆盖水平有关。
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免费试用NGS数据分析
在BaseSpace Sequence Hub中免费试用数据分析应用程序30天，无需购买仪器。您还将获得250次免费ICR编辑，以支付额外的存储或计算成本。
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