样本复用概述
多路复用排序允许在Illumina仪器上的单个运行过程中汇集大量库和同时进行排序。当靶向特定基因组区域或使用较小的基因组时，样本复用是有用的。汇集样品呈指数级增大在单个运行中分析的样本数量，而不会急剧增加成本或时间。
在下一代测序（NGS）文库制剂期间，将个体“条形码”序列添加到每个DNA片段中，从而可以在最终数据分析之前识别和分类每个读取。这些条形码或索引适配器，可以遵循两个主要的索引策略之一。Illumina适配器的选择取决于您的图书馆预备套件和应用。
多路复用测序了
- 快速高通量的策略:在单一实验期间可以同时测序大样本数量
- 经济高效的方法：样品池通过减少时间和试剂使用来提高生产率
- 简化的分析:使用Illumina数据分析软件的“条形码”自动样品识别
Illumina索引适配器概述
多重测序有两种类型的双索引选择:唯一双(UD)索引和组合双(CD)索引。
独特的双索引
UD索引在样本的两端使用唯一标识符。它涉及96个独特的索引1（i7）适配器和96个独特的索引2（i5）适配器，防止孔板中的重复序列。随着其他最佳实践以及独特的双重索引策略将有助于确保您的图书馆将在所有Illumina测序平台上以高精度解复用。
UD索引的好处：
- 更大的多路复用效率
- 与CD或单个索引相比，通过允许更多索引允许在测序运行中包含更多索引来降低每个样本成本
- 高度纯化并在良好的生产规范(GMP)条件下生产
- 改进了色彩平衡的设计
- 通过过滤跳读来缓解索引跳变
组合双索引
使用CD索引，具有I7索引的某些I5索引的组合允许样品识别。CD索引涉及12个唯一索引1适配器（I7）和8个唯一的索引2适配器（I5），因此在孔板的行和列中重复序列。
UD和CD索引适配器的比较
一个独特的双标板可以将96个样品汇集在一起。而组合对偶索引则仅限于8个唯一对偶对的索引组合。
| 应用程序 | 图书馆准备工具 | 推荐索引解决方案 |
|---|---|---|
| 全基因组测序 | Nextera DNA Flex Library Prep Kit | IDT为Illumina Nextera UD索引 |
| RNA序列 | TruSeq滞留mRNA TruSeq链总RNA |
Illumina - TruSeq RNA UD指数的IDT |
| 扩增子测序 | Amplumina Poinels | Illumina的AmpliSeq UD指标(≤24个样品) AmpliSeq CD Indexes for Illumina(适用于> 24个样品) |
| 有针对性的DNA富集 | Nextera Flex for Encroce | IDT为Illumina Nextera UD索引 |
使用Illumina适配器的资源
Illumina适配器序列
该文件包含了Illumina适配器的寡核苷酸序列，用于几个图书馆准备套件。
索引顺序指导
yobet亚洲了解Illumina测序系统的单索引和双索引测序。
Illumina适配器汇集指南
本文档提供了在使用索引库时在所有Illumina系统中优化颜色平衡的建议。
Illumina公司适配器支持
查找用于Illumina唯一双索引的IDT的有用资源和支持信息。
Chan Zuckerberg Biohub和Novaseq系统
陈-扎克伯格生物中心的研究人员正在进行创新实验，并在基因组学方面形成新的合作。NovaSeq系统使他们能够将许多样本捆绑在一起，用于可能有助于改善人类健康的医学研究。
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相关信息
- 最小化指数跳跃:查找使用Illumina适配器时避免顺序读取错误的提示和最佳实践。
- 高吞吐量库准备自动化:了yobet亚洲解旨在帮助实验室准备大量测序库的自动化液体处理解决方案。
- 咨询服务无论您是新应用NGS还是增加高通量测序，我们经验丰富的全球网络都可以提供帮助。