HiSeq 3000/HiSeq 4000系统的关键方法

在多种应用,物种和样品类型跨生产范围测序的速度,灵活性和性能

Hiseq 3000 / Hiseq 4000应用和方法

外显子组测序分析基因组的蛋白质编码区,作为全基因组测序的一种经济有效的替代方法。HiSeq 4000系统每次可测序多达96个外显子组*。

申请注意事项:HiSeq 4000系统的基因组、外显子组和转录组分析

*假设使用2×75bp读取的目标80%的覆盖率为80%。

对大型复杂基因组(人类、植物或动物)的全基因组测序(WGS)分析提供了基因组变化的逐个碱基视图,为疾病或种群基因组学研究提供信息。HiSeq 4000系统每次最多可以测序12个人类基因组。

申请注意事项:HiSeq 4000系统的基因组、外显子组和转录组分析

*假设>覆盖人类基因组30倍。

分析具有总RNA测序(RNA-SEQ)的编码RNA和多种非编码RNA,用于综合转录组。每次运行,Hiseq 4000系统可以序列最多100个转录om *。

申请注意事项:HiSeq 4000系统的基因组、外显子组和转录组分析

*假设每个样本读取5000万次。

甲基化测序

通过基于测序的DNA甲基化分析,提高表观遗传研究的高覆盖密度和灵活性。

申请注意事项:

HiSeq 3000/HiSeq 4000系统的亚硫酸氢盐全基因组测序

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基因表达分析

mRNA测序(mRNA- seq)检测已知的和新的转录本,并测量转录本的丰度,以准确、全面的表达谱。

申请注意事项:

HiSeq 4000系统的基因组、外显子组和转录组分析

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编码转录组分析

利用RNA编码区域的序列特异性捕获来检测RNA外显子组的已知和新特征。

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dna蛋白质相互作用分析

将染色质免疫沉淀(芯片)测定与测序相结合,芯片SEQ是基因调控的全基因组调查的强大方法。

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有针对性的DNA测序

定向重测序的重点是时间、费用和分析,只测序一个子集的基因或基因组区域的研究兴趣。

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小全基因组测序

小基因组测序为公共卫生、流行病学和疾病研究提供了微生物或病毒基因组的全面分析。

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新创测序

新创测序是指在没有参考序列的情况下对一个新的基因组进行测序。NGS能够快速、准确地表征任何物种。

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16 s rRNA测序

一种无培养的方法,用于鉴定和比较来自复杂微生物群或难以研究的环境中的细菌。

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翻译分析

核糖体分析使系统监测细胞翻译过程和预测蛋白质丰度。

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miRNA和小RNA分析

分离小RNA(如microRNA)并测序,研究非编码RNA在基因沉默和转录后调控中的作用。

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宏基因组

通过测序整个微生物群落来进行真正的宏基因组分析,以发现重要的分类和功能信息。

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基因分型结果进行排序

通过测序进行基因分型提供了一种低成本的基因筛选方法,可以发现新的植物和动物snp并进行基因分型研究。

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Cytogenomics

新一代测序提供了一个碱基一个碱基,全基因组染色体变异检测,以补充阵列为基础的细胞基因组分析。

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靶向RNA表达分析

靶向RNA测序(RNA- seq)侧重于特定的转录本,用于分析基因表达和识别融合基因。

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目标基因的面板

目标基因测序面板包含明确的探针集,专注于特定的基因感兴趣。可以使用预先设计的和自定义的面板。

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RNA药物反应生物标志物发现

了解如何利用RNA-Seq发现和分析基于rna的药物反应生物标志物。访问旨在帮助新用户采用此应用程序的资源。

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Illumina公司方法指南

方法指导

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