ChIP-Seq是什么?
通过将染色质免疫沉淀(ChIP)分析与测序相结合，ChIP- seq (ChIP- seq)是一种识别转录因子和其他蛋白质的全基因组DNA结合位点的强大方法。根据ChIP协议，dna结合蛋白使用特定抗体免疫沉淀。然后结合的DNA共沉淀，纯化，测序。
下一代测序技术(NGS)在ChIP上的应用揭示了在各种疾病和生物途径中发挥作用的基因调控事件，如发展和癌症进展。ChIP-Seq可以在全基因组范围内彻底检查蛋白质和核酸之间的相互作用。
ChIP-Seq的优点
与用于研究表观蛋白酶的阵列和其他方法不同，这本质上是偏置的，因为它们需要衍生自已知序列的探针，芯片SEQ不需要先验知识。CHIP-SEQ通过大规模平行测序提供基因组分析，在多个样品上产生数百万计数，以进行成本效益，精确，对表观遗传模式的调查。其他优点包括：
- 在任何生物体的整个基因组中捕捉转录因子或组蛋白修饰的DNA目标
- 定义转录因子绑定站点
- 结合RNA测序和甲基化分析揭示基因调控网络
- 提供与各种输入DNA样本的兼容性
ChIP-Seq是如何工作的?
CHIP-SEQ识别DNA相关蛋白的结合位点，可用于映射给定蛋白质的全局结合位点。芯片SEQ通常以DNA蛋白复合物的交联。然后将样品碎片并用外切核酸酶处理以修剪未结合的寡核苷酸。蛋白质特异性抗体用于免疫沉淀DNA-蛋白质复合物。提取和测序DNA，给予蛋白质结合位点的高分辨率序列。
推荐ChIP-Seq工作流
互动分析报告
全面的芯片 - SEQ工作流程
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用于从芯片衍生的DNA制备芯片-SEQ文献的简单，经济有效的方法。
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MiSeq系统
以每次运行序列1-6芯片-SEQ样本的聚焦电量。
nextseq 550系统灵活的电源序列8-24芯片序列样品在并行。
NovaSeq 6000系统可扩展的吞吐量和灵活性，几乎任何基因组，测序方法和项目规模。
HiSeq 4000系统生产能力序列4-150 ChIP-Seq样品
平行，取决于目标蛋白。
BaseSpace序列中心
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BaseSpace关联引擎为支持研究人员识别疾病机制、药物靶点和生物标记物而策划的基因组数据的一个日益增长的图书馆。
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*文件上的数据计算。yobet亚洲Illumina，Inc。，2015