什么是从头排序？
新创测序是指对一个没有参考序列的新基因组进行测序。序列读取被组装成contigs，并且覆盖质量从头序列数据取决于CONDIG的大小和连续性（即，数据中的间隙的数量）。
与传统方法相比，下一代测序（NGS）能够更快，更准确地表征任何物种，例如Sanger测序。Illumina提供伙伴对测序和长读技术，以补充较短的读取，以实现任何物种的全面，准确表征。
优点从头测序
- 即使对于复杂或多倍体基因组，也产生准确的参考序列
- 为绘制新生物的基因组或完成已知生物的基因组提供有用的信息
- 澄清高度相似或重复的区域，以便准确从头装配
- 识别结构变体和复杂的重排，如缺失、倒置或易位
精确基因组组装
当第一次对基因组进行测序时，使用组合方法进行更高质量的组装。结合短插入、成对末端和长插入，配对序列是最大化覆盖的理想方式。在较高深度进行的短读取可以填补长插入未覆盖的空白。
这种组合能够检测最广泛的结构变异类型，对于准确识别复杂的重排至关重要。合成长读数还可以通过提供从较短读数“缝合”在一起的长重叠来帮助组装，以保持准确性。
推荐的工作流程从头细菌测序
大会报告
Prokka输入表格
综合的从头基因组测序工作流程
Illumina合成测序（SBS）化学是最广泛采用的NGS技术，产生了全球约90%的测序数据*
除了行业领先的数据质量，Illumina还提供集成的工作流程从头排序，从库准备到数据分析。
点击下面查看每个工作流程步骤的产品。
Nextera配对库准备套件
从低DNA输入中制备用于测序的配对文库的无凝胶和凝胶加方法。
10x基因组学铬基因组文库准备试剂盒全基因组准备，为Illumina平台上低DNA输入的测序提供不同的调用和阶段。
燕尾服务新创使用专有燕尾榫进行大范围基因组组装商标从Illumina平台上的多个DNA输入。
米塞克系统
快速和简单的目标和小基因组测序。
NextSeq 550系统灵活的桌面定序器支持多个应用程序，每个运行排序1 Nextera Mate对样本。
Hiseq 4000系统生产规模基因组学的高通量和低成本。
Novaseq 6000系统
几乎任何基因组、测序方法和项目规模的可伸缩的吞吐量和灵活性。
平台比较工具比较测序平台，确定适合您的实验室和应用的最佳系统。
测序试剂寻找包含针对每个illumina测序系统定制的测序试剂，流动细胞和/或缓冲剂的试剂盒。
Nextera Mate对
BaseSpace SPAdes Genome Assembler App新创适用于单细胞和分离基因组的汇编程序。
天鹅绒从头装配应用程序新创利用Velvet汇编器组装细菌基因组，重点关注Nextera Mate Pair数据。
NovaSeq S4 Flow Cell来了
Novaseq 6000系统的试剂盒现在可以采用三个流动单元配置：S1是较小的批量尺寸或需要快速周转时间的情况下的理想选择。S2是用于高吞吐量应用的快速，强大，经济高效的选项。S4提供可调输出和额外的灵活性。
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*数据计算存档。yobet亚洲Illumina公司有限公司,2015年版