独特的分子标识符是什么?
独特的分子标识符(umi)是一种分子条码测序期间提供纠错和提高精度。
这些分子条形码短序列用于独特的标记样本库中的每一个分子。umi用于广泛的测序应用,许多在PCR重复DNA和互补。UMI重复数据删除也有用RNA-seq基因表达分析和其他定量排序的方法。
独特的分子标识符的好处
测序umi可以减少假阳性变体电话和增加变异检测的灵敏度。因为每个核酸的起始物料与一个独特的分子条码标记,生物信息学软件可以过滤掉重复的读取和PCR与高水平的准确性和错误报告独特的读取,删除标识错误之前最后的数据分析。
独特的分子标识符与独特的双索引
虽然这两种技术用于多路复用和多路分解在下游数据分析,关键的区别是,UMI测序标签样本中的每一个分子与一个独特的序列PCR扩增前。
具有独特的双索引(udi),每个样本指数是特定于一个给定的样本库。所有标有相同样品中核酸序列标签,以及由此产生的与其他图书馆和图书馆是集中在单个运行并行测序。
UMI是如何工作的呢?
umi包含一个独一无二的条形码到每个分子在一个给定的样本库。通过将单个条形码在每个原始DNA片段,变异等位基因出现在原样品(真正的变体)可以区别错误引入图书馆准备期间,目标浓缩或测序。
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