测量基因和转录本丰度;检测编码和非编码RNA的已知和新特征。靶向杂交去除丰富的rRNA,集中在转录组的高价值部分。
量化基因表达,确定编码转录组中已知和新的异构体,检测基因融合,并测量等位基因特异性表达。
在一组关注的基因中分析基因表达。提供定量表达信息以及检测小变异和基因融合。
使用聚合酶链反应(PCR)扩增子超深测序,分析感兴趣的RNA序列,差异表达分析,等位基因特异性表达测量,基因融合验证。
应用程序 | 产品 | 好处 |
---|---|---|
总RNA序列 | Illumina链总RNA Prep |
|
信使rna序列 | Illumina链mRNA准备 |
|
有针对性的RNA序列 | Illumina RNA浓缩Prep |
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应用程序 | 全转录组 | 信使核糖核酸 | RNA浓缩 |
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实践时间 | <3小时 | <3小时 | < 2小时 |
周转时间 | ~ 7小时 | 6.5小时 | <9小时 |
输入 | 1 ~ 1000ng标准质量RNA;10ng为最佳性能和FFPE样品 | 25 ~ 1000ng标准质量RNA | 10ng标准质量RNA;20ng RNA用于低质量/降解/ FFPE |
自动化能力 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
PCR协议 | 没有 | 没有 | 是的 |
图书馆需要定量? | 是的 | 是的 | 是的 |
包括碎片? | 是的 | 是的 | 不是必需的 |
产品 | Illumina链总RNA Prep | Illumina链mRNA准备 | Illumina RNA浓缩Prep |
所有三种试剂盒都允许您通过在单个NovaSeq S4 Flow Cell上装载多达384个样品来降低测序成本,使用384个独特的双指标进行更高的通量测序。
串珠转座子标记技术是一项创新技术,应用于我们的图书馆制备组合。通过同时将gDNA片段化并添加Illumina测序引物,单粒标记可以让你比以前更快地获得序列就绪库。在没有辅助试剂或设备的情况下使您的图书馆正常化。减少周转时间和复杂性。
亚博官网人口我们在NGS库准备中使用的另一项关键技术是适配器连接,它长期以来以一致性、高质量的数据而闻名。文库的制备方法是将gDNA或cDNA样本片段化,并将特定的适配器连接到片段两端。这些适配器包含测序引物杂交位点的全部补充。这消除了额外PCR步骤的需要,使过程完全自动化。
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两种流行的RNA文库预备试剂盒之间的关键比较揭示了RNA测序研究人员感兴趣的新信息。
一套全面的NGS分析方法:
这篇文章集合描述了RNA测序的各种NGS方法,由科学文献汇编,包括正反两方面,发表摘要和参考文献。
增加每次运行测序的样本数量,并使用唯一的双索引适配器优化高通量测序。
独特的分子识别器(UMIs)提供错误校正和准确性,并可以减少假阳性变异调用,同时增加变异检测灵敏度。
我们的合作伙伴已经开发了高吞吐量和低吞吐量的自动化方法,这些方法跨越了我们的库准备组合。
在没有预先知识的情况下,在单一检测中检测已知和新的特征,包括转录本亚型、基因融合和单核苷酸变异。