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总RNA测序

全RNA测序简介

全转录组分析与总RNA测序(RNA- seq)检测编码和多种形式的非编码RNA。Total RNA-Seq能够准确测量基因和转录本丰度,并识别转录组的已知和新特征。

总RNA-SEQ在正常或低质量样品中提供最佳覆盖范围。物种特异性核糖体RNA探针可以有效去除丰富的RNA物种。这使得图书馆捕获的碎片和完整的绩效表单均留下。

总RNA测序的优点

总RNA测序的优点

总RNA-SEQ分析编码和多种形式的非分量RNA,以综合转录组。

  • 捕获已知和新颖的功能
  • 允许研究人员在最广泛的成绩单范围内识别生物标志物
  • 使更全面的理解表型的兴趣
  • 允许在广泛的动态范围内分析整个转录组
从全基因组阵列转变为总RNA测序

从全基因组阵列转换到总RNA-SEQ

波士顿大学医学中心(Boston University Medical Center)的肺科和重症监护医师阿夫鲁姆·斯皮拉(Avrum Spira)博士启动了一个实验室,目标是用全基因组基因表达阵列分析样本,研究肺部疾病的潜在生物标志物。yobet亚洲了解斯皮拉的实验室如何使用总RNA-Seq来发现可能无法在表达阵列检测到的新颖和罕见的转录本。
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总RNA测序工作流程

通过合成(SBS)化学的Illumina测序是最广泛采用的下一代测序(NGS)技术,产生大约90%的全局测序数据。*

除了高质量的数据外,Illumina还提供集成的全转录组测序工作流,简化了整个过程,从图书馆准备到数据分析和生物解释。

RNA测序考虑因素

每种RNA- seq实验类型——无论是基因表达谱、靶向RNA表达还是小RNA分析——对读取长度和深度都有独特的要求。本公告回顾了实验方面的考虑,并提供了帮助研究设计的资源。

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RNA测序考虑因素

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*数据计算存档。yobet亚洲Illumina公司有限公司,2015年版