单细胞分辨率下拟南芥根系的调控景观

在植物中，染色质可及性——调节DNA的主要标志——在组织和环境中是相对静止的。这种缺乏的动态或组织特异性的位点可能是部分归因于先前的散装研究中的组织异质性。为了评估组织异质性的影响，我们将单细胞ATAC-SEQ施加到A. Thaliana Roots并确定成千上万的差异可接近的部位，足以解决根的所有主要细胞类型。然而，即使在动态站点的数量中相对于批量研究的这种巨大增加也无法解决可访问性和表达之间的个别基因座的不良相关性。相反，我们发现整个细胞的监管景观及其转录组合每个捕获细胞类型的身份独立。我们利用该分享信息有关细胞标识的集成，以集成可访问性和转录组数据，以表征根部中的发育进展，exodoruplication和细胞分区。我们进一步使用组合数据来表征大型转录因子家族的细胞类型特定的主题富集，并将各个家庭成员的表达联系在特定基因座上改变特定基因座的可访问性，以解决形状基因表达的直接和间接影响的第一步．我们的方法提供了一种分析框架，可推断执行植物开发的基因监管网络。

Josh Cuperus博士
研究助理教授
华盛顿大学基因组科学系

Josh Cuperus博士是华盛顿大学在基因组科学系的研究助理教授。乔希有来自俄勒冈州立大学的微生物学和细胞和分子生物学。他一直将基于测序的技术应用于植物15年，重点介绍小型RNA生物学，基因调控和染色质景观。

史蒂夫霍夫曼，博士
单细胞排序的段营销经理
伊洛米娜

Adriana Suarez，Phd
科技顾问
10倍基因组学