规范

规范

功能 描述
数量的标记 2379855年
自定义标记数 200,000
每个BeadChip的样本数量 8
DNA的要求 200 ng
分析 英飞纳姆®LCG
工具支持 HiScanSQ或iScan
样品处理量* ~ 1067个样品/周
每个样本的扫描时间 6.5分钟(HiScanSQ)
11.4分钟(iScan)

%的变化捕获
(右2> 0.8)

1 kGP *
加器> 5%

1 kGP *
加器> 1%

CEU

0.83 0.73

慢性乙肝+ JPT

0.83 0.73

0.65 0.51
数据表现 值* * * /产品规范
调用率 99.65% / >平均
再现性 99.99% / > 99.9
日志R偏差 0.12 / < 0.30
间距 平均/中等/ 90% *
间距(kb 1.19 / 0.64 / 2.76
标记类别 标记数量*
具有10kb RefSeq的SNPs数量 1231382年
MHC / ADME 19238/27335
非同义单核苷酸多态性 41900年
性染色体
(X / Y / PAR轨迹)
55 208 / 2 561/ 418
线粒体 256

__估计假设一个HiScan系统,一个AutoLoader2,一个Tecan机器人,每周工作五天。

*与2011年6月发布的1kGP数据相比。

**值来自470个参考样本的基因分型。

典型项目的预期值,不包括肿瘤样本或任何未按照标准Illumina协议制备的样本。