功能 | 描述 |
数量的标记 | 2379855年 |
自定义标记数 | 200,000 |
每个BeadChip的样本数量 | 8 |
DNA的要求 | 200 ng |
分析 | 英飞纳姆®LCG |
工具支持 | HiScanSQ或iScan |
样品处理量* | ~ 1067个样品/周 |
每个样本的扫描时间 | 6.5分钟(HiScanSQ) 11.4分钟(iScan) |
%的变化捕获 |
1 kGP * |
1 kGP * |
CEU |
0.83 | 0.73 |
慢性乙肝+ JPT |
0.83 | 0.73 |
套 |
0.65 | 0.51 |
数据表现 | 值* * * /产品规范 |
调用率 | 99.65% / >平均. |
再现性 | 99.99% / > 99.9% |
日志R偏差 | 0.12 / < 0.30‡ |
间距 | 平均/中等/ 90% * |
间距(kb) | 1.19 / 0.64 / 2.76 |
标记类别 | 标记数量* |
具有10kb RefSeq的SNPs数量 | 1231382年 |
MHC / ADME | 19238/27335 |
非同义单核苷酸多态性 | 41900年 |
性染色体 (X / Y / PAR轨迹) |
55 208 / 2 561/ 418 |
线粒体 | 256 |
__估计假设一个HiScan系统,一个AutoLoader2,一个Tecan机器人,每周工作五天。
*与2011年6月发布的1kGP数据相比。
**值来自470个参考样本的基因分型。
‡典型项目的预期值,不包括肿瘤样本或任何未按照标准Illumina协议制备的样本。