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本培训提供了对Infinium分析的介绍。它列出了Infinium检测的步骤,描述了每一步的生化机制,并解释了不同基因型如何产生不同的荧光信号。
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您正在寻找优化Infinium基因分型数据分析工作流效率的方法吗?来学习如何yobet亚洲Beeline 2.0软件可以帮助!本次网络研讨会面向具有在GenomeStudio中使用基因分型数据的基本知识的新中级用户。我们将讨论以下主题:从Infinium基因分型数据生成GTC文件,Beeline 2.0功能:QC、过滤、报告和GenomeStudio集成,以及Infinium基因分型数据分析工作流程的示例。
本次网络研讨会面向对GenomeStudio中评估数据质量基础知识感兴趣的标准Infinium产品和定制iSelect BeadChips用户。我们将演示如何使用GenomeStudio Controls Dashboard对Infinium基因分型数据进行有效的分析、QC和故障排除。本次网络研讨会将涵盖在Infinium基因分型分析中使用的不同类型的对照剂,它们在分析工作流程中发挥作用的地方,以及每个对照剂的预期结果。这些概念将在GenomeStudio的实时故障排除演示中应用。演讲结束后将立即进行问答环节。
GenomeStudio 2.0 Polyploid genome typing Module提供算法,用于聚类和输出非二倍体物种的基因型,如马铃薯。本次网络研讨会面向具有非二倍体基因分型数据处理知识的中级和高级GenomeStudio用户,将涵盖以下主题:在GenomeStudio 2.0中加载一个多倍体基因分型项目;支持的两种多倍体类型:同源多倍体和异源多倍体;多倍体聚类的两种算法:PolyGentrain和DBSCAN;一般和算法特定的聚类选项,和手动操作聚类,并导出最终报告和多倍体基因分型聚类文件(.egtp)。
使用您自己的样本进行聚类对于定制数组内容是必要的,并将为任何项目生成最准确的数据,特别是对于非典型样本,如FFPE样本。这个研讨会是针对新和中级用户GenomeStudio处理基因分型数据的基本知识,将会在接下来的话题:集群文件基础,当使用一个自定义集群文件时,如何创建一个自定义集群文件,以及如何过滤和手动编辑优化集群文件。
本次网络研讨会面向所有级别的GenomeStudio用户。我们将演示在GenomeStudio基因分型、甲基化和表达模块中使用一些可用的工具和技术,包括:遗传力和重现性分析;一致性工具-热图,树突状图,直方图/频率图;和图像查看-散点绘图工具。
根据Infinium的最佳实践,优化Infinium的数据质量。对于新用户和有经验的用户,本次网络研讨会将涉及Infinium工作流的所有方面:实验室设置和维护,实验室跟踪,Infinium分析技巧,数据管理。
更正:幻灯片26(时间戳29:44)第三个要点- PB1应该读成PB2
|加入我们的演讲和讨论中包含的信息,我们的基因分型,基因表达,甲基化BeadChips。我们将讨论什么是清单,以及GenomeStudio如何利用它从我们的扫描仪记录的强度信息中生成数据。我们还审查了各种清单中列出的信息类型,特别是与链分配相关的列,以及如何使用这些信息解读来自GenomeStudio的各种输出报告。最后,我们讨论了从Illumina提供的其他资源,以增强我们对manifest内容的理解,以及各种工具来补充内容。