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cBot 2系统为排序工作流的聚类生成步骤提供了积极的样本跟踪。仪器记录试剂的条形码ID,流细胞,库模板,以及任何定制的或用于运行的额外引物。您可以配置您的cBot 2系统来与LIMS共享这些id,或者在独立模式下工作。
不。原来的流形在新仪器上不能正确对齐。
首次处理模板DNA时,尝试浓度滴定范围以优化形成的簇数。如果浓度太低,则产生较少的簇并导致低测序产率。如果浓度太高,则簇太密集并且可以使数据分析复杂化。有关更多信息,请参阅测序文库qPCR定量指南(需要迈马坦登录)或HISEQ系统变性和稀释库指南。
是的,但确保在CBOT 2系统上群集的库类型与您的测序仪器兼容。例如,Hiseq X仅与Truseq纳米DNA和Truseq DNA PCR的文库兼容。
是的。所有用于cBot系统的集群套件也与cBot 2系统兼容。
使用键控8管条对样品跟踪很重要。使用海马生物科学目录# 204026-100,它提供了8管的条形码标签,专门设计用于cBot 2。
对于图书馆,您只能在CBOT 2系统上使用未标记的8管条,仅适用于没有示例跟踪的运行。无论运行类型如何,都使用UnlableLed 8管条带有所有自定义或附加引物。
默认情况下,正向样本跟踪选项是打开的。有关示例跟踪和其他配置选项的详细信息,请参见cBot系统配置指南。
条码信息被记录并存储在运行数据文件(*.xml)中。该文件被写入首选网络位置,您可以从LIMS选项卡配置该位置。
对于样品跟踪的运行,耗材在装入仪器并盖上盖子后进行内部扫描。使用外部扫描仪记录可消耗的id运行没有样本跟踪。
如果消耗品不能在内部扫描,该软件提供使用外部扫描仪或屏幕键盘的选项。对于未在内部扫描的消耗品,不提供样本跟踪,但条码id总是存储在运行数据文件中,而不管样本跟踪。
不可以。CBOT 2歧管包括允许流动单元扫描仪读取流量单元条码的间隙。新的歧管替换所有CBOT簇套件中的现有歧管。
使用cBot软件v3.0.40或更高版本。以前版本的cBot软件不兼容。