4000年HiSeq常见问题

每种系统可以在3.5天内产生高达1.5 TB，从2 x 150 BP运行，Q30的基础大于75％。此吞吐量可在每个系统的每次运行30倍时最多可达12个基因组。有关更多信息，请参阅HiSeq 3000/4000系统规格。

不。升级包(目录# SY-401-4002)仅适用于HiSeq 3000系统。

自定义底漆尚未在HiSeq 4000系统上进行测试。

HiSeq 4000是一个开放平台，旨在支持广泛的应用程序。到目前为止，经过验证的应用包括全基因组测序、RNA测序和外显子组测序。有关更多信息，请参阅Hiseq 3000 / Hiseq 4000应用。

与Hiseq 2500系统一样，Hiseq 4000被设计为旨在支持广泛应用的开放式平台。内部，Illumina已经运行了众多图书馆预备套件，没有问题。对于示出系统性能的示例数据，请参阅HiSeq 3000/4000 Sample datasheet(数据表)11 page - HiSeq 3000/4000。

HiSeq 4000系统可兼容当前对端P5和P7引物。单读和双端库与HiSeq 4000兼容，但必须使用当前的适配器。基于原始Illumina单读适配器的遗留库不能正确地集群。

真正的低多样性样品，如单扩增子和16S样品，不期望产生高质量的结果。然而，在一个平衡良好的基因组(如PhiX)中激增可以提高性能。

图案化的流动池具有数十亿个有序的纳米线，该纳米线制成流动细胞玻璃。订购的井允许以有序的布置生成测序簇。集群更紧密地对齐，增加输出读数的数量和生成的序列数据量。

HiSeq 3000/4000型流单元有八个通道，与HiSeq高输出流单元一般尺寸相同。

HiSeq 3000/4000 SBS Kit和HiSeq 3000/4000 Cluster Kit中提供的试剂和流细胞是针对HiSeq 4000和HiSeq 3000系统设计和优化的。为其他HiSeq系统设计的试剂不兼容HiSeq 4000和HiSeq 3000系统。

Hissq 4000的支持读取长度最多2 x 150 bp。三个套件尺寸（50周期，150周期和300周期）可用于支持一系列读取长度。

是的，任何8通道高输出流量单元的集群生成都需要cBot系统，包括HiSeq 3000/HiSeq 4000模式流量单元。仪器上的聚类是快速运行模式的一个特点，只有HiSeq 2500和HiSeq 1500系统可以使用。您可以使用任何运行cBot软件v3.0或更高版本的cBot系统来集群HiSeq 3000/HiSeq 4000模式流单元。

HiSeq 3000/4000试剂盒支持单标和双标选择。SBS试剂盒包括足够的试剂用于18个额外的索引测序周期。索引引物提供了单和双索引引物。

不，索引引物是特定于SR或PE群集工具包，因为索引工作流程是不同的每种流单元类型。创建工作流的详细信息请参见索引测序概述指南（文档＃15057455）。

对于配对末端流动单元;否是单读流电池。双索引工作流程根据流动单元类型而异。有关每个工作流程的详细信息，请参阅索引测序概述指南（文档＃15057455）。

每月更换含有维护清洗液的洗涤瓶和洗涤管通常就足够了。虽然水大约每周更换一次，但通常每六个月更换一次瓶子和水管。

是的。4.8.46或更高版本需要从Hiseq 4000运行查看数据。您可以在计算机上下载sav，或使用BaseSpace序列集线器。

有关与HCS版本兼容的SAV版本，请参见高碳钢发布说明。

您可以使用2 x 150 bp运行，期望高于Q30以上所有基础的75％。有关更多信息，请参阅HiSeq 3000/HiSeq 4000系统规格。

BaseSpace是HiSeq 4000的首选分析方案。对于第三方分析包，可以使用bcl2fastq转换器。CASAVA和HAS不支持。

是的。如果有网络存储，服务器存储大小可以存储一次运行。当网络恢复时，实时分析继续处理并恢复数据传输。

对Hiseq 3000/4000流动单元的扫描和分析在每巷的两个表面上以每表面的两个条子进行。每个条款分为28个瓷砖。因此，每个流动单元包含896个瓷砖。