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本试验中使用的适配器是针对AmpliSeq工作流程进行优化的。Nextera或TruSeq适配器不兼容本试验。
请参阅内容和存储。
在相同的测序运行中，可以为Illumina设计运行3种不同的AmpliSeq，每种都带有条形码。然而，您的目标放大器尺寸和所需的覆盖范围必须在一次运行中实现。
建议使用2×151 bp成对端读取。
看到产品的兼容性。
您可以通过增加测序吞吐量(例如，更大的流单元输出或测序平台)或减少每次运行汇集的样本数量来控制覆盖率。
DNA扩增子分析工作流程可以用来执行对齐和变异调用。Local Run Manager和BaseSpace Sequence Hub都有可供分析的应用程序。DNA扩增子分析应用程序可在BaseSpace序列中心。可以使用BaseSpace变体解释器对任何变体调用执行进一步的分析。Local Run Manager有一个类似的DNA Amplicon分析模块，它使用了与BaseSpace序列中心应用程序相同的工作流程和算法。
是的，在BaseSpace公共数据中有示例数据集。
在目标基础上显示了参考基因组中的靶区域的总测序碱基的百分比。该度量反映了A）从扩增子的基础的百分比被设计，合成和汇集和B)生成序列数据映射到目标区域。