AmpliSeq用于Illumina综合面板v3兼容产品

样品信息

在准备库之前,使用可用的选项记录关于示例的信息NextSeq 550系统

图书馆准备

面板描述

Illumina综合面板v3的AmpliSeq提供了关键癌症基因的覆盖,包括激酶域和涉及DNA修复的基因。

组件 数量的池 浓度 数量的扩增子 平均扩增子长度(bp) 平均库长(bp)
DNA 2 2 x 3781 105 245
核糖核酸 2 5倍 867 99 239
图书馆准备和索引工具包

完成Illumina综合面板v3协议的AmpliSeq需要面板和下面的库准备和索引工具包。Illumina Library PLUS试剂盒的AmpliSeq有24-、96-和384-反应配置。

数量的样品

Illumina综合面板v3协议的AmpliSeq为每个样本生成一个DNA和一个RNA库。样本可以是DNA、RNA或配对的。此协议的示例是成对的。样本是来自一个来源的核酸标本,而库是制备后的样本的核酸。文库是一种独特的DNA或RNA制剂,具有测序所需的末端。

准备适当数量的样品需要以下数量和组合试剂盒。

数量的样品 24个样品 96个样本 384个样本
数量的图书馆 48个图书馆
(24个dna, 24个rna)
192库
(96个dna, 96个rna)
768库
(384个dna, 384个rna)
Illumina综合面板v3放大器eq 1 4 16
AmpliSeq图书馆加上Illumina 2 24-reaction包 2包96 -反应 2包384 -反应
AmpliSeq CD Set A(96反应,96指标) 1 2 8
互补脱氧核糖核酸的合成 1 1 4

测序的指导方针

Illumina综合面板v3库的序列扩增eq使用以下系统和试剂盒。

DNA样本
系统 试剂盒 样品每运行
MiniSeq系统 迷你eq高输出试剂盒 3.
MiSeq系统 MiSeq试剂盒v3 3.
NextSeq系统 NextSeq中输出工具包v2 16
NextSeq高输出工具包v2 48
RNA样本
系统 试剂盒 样品每运行
MiniSeq系统 MiniSeq中输出试剂盒 24
迷你eq高输出试剂盒 80
MiSeq系统 MiSeq试剂Nano Kit v2 3.
MiSeq试剂盒v2 12
MiSeq试剂盒v2 48
MiSeq试剂盒v3 80
结合DNA和RNA样本
系统 试剂盒 每次运行的DNA样本 每次运行的RNA样本 每次运行的组合样本
MiniSeq系统 迷你eq高输出试剂盒 3. 3. 6
MiSeq系统 MiSeq试剂v3 3. 3. 6
NextSeq系统 NextSeq中输出工具包v2 16 16 32
NextSeq高输出工具包v2 48 48 96