在准备库之前,使用可用的选项记录关于示例的信息NextSeq 550系统.
Illumina综合面板v3的AmpliSeq提供了关键癌症基因的覆盖,包括激酶域和涉及DNA修复的基因。
组件 | 数量的池 | 浓度 | 数量的扩增子 | 平均扩增子长度(bp) | 平均库长(bp) |
---|---|---|---|---|---|
DNA | 2 | 2 x | 3781 | 105 | 245 |
核糖核酸 | 2 | 5倍 | 867 | 99 | 239 |
完成Illumina综合面板v3协议的AmpliSeq需要面板和下面的库准备和索引工具包。Illumina Library PLUS试剂盒的AmpliSeq有24-、96-和384-反应配置。
Illumina综合面板v3协议的AmpliSeq为每个样本生成一个DNA和一个RNA库。样本可以是DNA、RNA或配对的。此协议的示例是成对的。样本是来自一个来源的核酸标本,而库是制备后的样本的核酸。文库是一种独特的DNA或RNA制剂,具有测序所需的末端。
准备适当数量的样品需要以下数量和组合试剂盒。
数量的样品 | 24个样品 | 96个样本 | 384个样本 |
---|---|---|---|
数量的图书馆 | 48个图书馆 (24个dna, 24个rna) |
192库 (96个dna, 96个rna) |
768库 (384个dna, 384个rna) |
Illumina综合面板v3放大器eq | 1 | 4 | 16 |
AmpliSeq图书馆加上Illumina | 2 24-reaction包 | 2包96 -反应 | 2包384 -反应 |
AmpliSeq CD Set A(96反应,96指标) | 1 | 2 | 8 |
互补脱氧核糖核酸的合成 | 1 | 1 | 4 |
Illumina综合面板v3库的序列扩增eq使用以下系统和试剂盒。
系统 | 试剂盒 | 样品每运行 |
---|---|---|
MiniSeq系统 | 迷你eq高输出试剂盒 | 3. |
MiSeq系统 | MiSeq试剂盒v3 | 3. |
NextSeq系统 | NextSeq中输出工具包v2 | 16 |
NextSeq高输出工具包v2 | 48 |
系统 | 试剂盒 | 样品每运行 |
---|---|---|
MiniSeq系统 | MiniSeq中输出试剂盒 | 24 |
迷你eq高输出试剂盒 | 80 | |
MiSeq系统 | MiSeq试剂Nano Kit v2 | 3. |
MiSeq试剂盒v2 | 12 | |
MiSeq试剂盒v2 | 48 | |
MiSeq试剂盒v3 | 80 |
系统 | 试剂盒 | 每次运行的DNA样本 | 每次运行的RNA样本 | 每次运行的组合样本 |
---|---|---|---|---|
MiniSeq系统 | 迷你eq高输出试剂盒 | 3. | 3. | 6 |
MiSeq系统 | MiSeq试剂v3 | 3. | 3. | 6 |
NextSeq系统 | NextSeq中输出工具包v2 | 16 | 16 | 32 |
NextSeq高输出工具包v2 | 48 | 48 | 96 |