AmpliSeq for Illumina Exome Panel faq

本分析中使用的适配器针对AmpliSeq工作流程进行了优化。Nextera或TruSeq适配器与本分析不兼容。

请参阅内容和存储。

可以运行3个不同的AmpliSeq为Illumina设计的条形码在相同的测序运行。然而，您的目标放大器大小和所需的覆盖范围必须在一次运行。

推荐使用2×151 bp对端读取。

看到产品的兼容性。

您可以通过增加测序吞吐量(例如，一个更大的流式细胞输出或测序平台)或减少每次运行汇集的样本数量来操纵覆盖率。

DNA扩增子分析工作流可用于执行比对和变异调用。本地运行管理器和BaseSpace Sequence Hub有可用的应用程序进行分析。DNA扩增分析应用程序可在BaseSpace Sequence Hub上使用。可以使用BaseSpace variant Interpreter对任何变体调用执行进一步的分析。Local Run Manager有一个类似的DNA Amplicon分析模块，它使用与BaseSpace Sequence Hub应用程序相同的工作流和算法。

是的，在BaseSpace公共数据中有示例数据集。

靶上碱基显示了在参考基因组中映射到靶区域的总测序碱基的百分比。这个指标反映了扩增子中a)被设计、合成和汇集的碱基的百分比和B)生成序列数据映射到目标区域。