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本试验中使用的适配器是针对AmpliSeq工作流程进行优化的。Nextera或TruSeq适配器不兼容本试验。
参见内容和存储。
在相同的测序运行中，可以为Illumina设计运行3种不同的AmpliSeq，每种都带有条形码。然而，您的目标放大器尺寸和所需的覆盖范围必须在一次运行中实现。
建议使用2×151 bp成对端读取。
看到产品的兼容性。
您可以通过增加测序吞吐量(例如，更大的流单元输出或测序平台)或减少每次运行汇集的样本数量来控制覆盖率。
Local Run Manager和BaseSpace Sequence Hub都有可供分析的应用程序。DNA扩增子分析应用程序和RNA扩增子分析应用程序可以在BaseSpace Sequence Hub上获得。可以使用BaseSpace变体解释器对任何变体调用执行进一步的分析。Local Run Manager有一个类似的DNA Amplicon分析模块和RNA Amplicon分析模块，使用了与BaseSpace序列中心应用程序相同的工作流程和算法。
DNA扩增子分析工作流程可用于执行比对和变异调用，RNA扩增子分析工作流程可用于融合调用。此外，OncoCNV呼叫者，一个BaseSpace实验室应用程序可用于CNV分析。
是的，在BaseSpace公共数据中有示例数据集。
目标上的碱基显示了在参考基因组中映射到目标区域的总测序碱基的百分比。这个指标反映了a)被设计、合成和汇集的扩增子的碱基百分比和B)生成序列数据映射到目标区域。
不。任何包含融合的RNA面板的清单文件在非加密格式中是不可用的。只有加密的清单文件可用。
关于包含在所有RNA融合面板设计的确切断点的信息没有提供。Illumina软件分析工具生成的结果文件提供了软件识别的任何RNA融合事件的细节。有关您的专家组评估哪些基因对的信息，请参阅专家组的数据表。
Illumina软件包，包括BaseSpace Sequence Hub应用程序，不提供对齐文件作为分析的输出。目前，只提供分析结果的最终报告。要了解更多细节，请参考软件文档。
不。该软件只报告检测到的融合事件。有关您的专家组评估哪些基因对的信息，请参阅专家组的数据表。