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本试验中使用的适配器是针对AmpliSeq工作流程进行优化的。Nextera或TruSeq适配器不兼容本试验。
参见内容和存储。
在相同的测序运行中，可以为Illumina设计运行3种不同的AmpliSeq，每种都带有条形码。然而，您的目标放大器尺寸和所需的覆盖范围必须在一次运行中实现。
建议使用2×151bp配对结束读数。
请参阅产品兼容性。
您可以通过增加测序吞吐量（例如，更大的流量小区输出或测序平台）来操作覆盖范围，或者减少每次运行汇集的样本数量。
Local Run Manager和BaseSpace Sequence Hub都有可供分析的应用程序。DNA扩增子分析应用程序和RNA扩增子分析应用程序可以在BaseSpace Sequence Hub上获得。可以使用BaseSpace变体解释器对任何变体调用执行进一步的分析。Local Run Manager有一个类似的DNA Amplicon分析模块和RNA Amplicon分析模块，使用了与BaseSpace序列中心应用程序相同的工作流程和算法。
DNA扩增子分析工作流程可用于执行比对和变异调用，RNA扩增子分析工作流程可用于融合调用。此外，OncoCNV呼叫者，一个BaseSpace实验室应用程序可用于CNV分析。
是的，Basespace公共数据中存在示例数据集。
使用BaseSpace DNA Amplicon 2.0或更高版本，本地运行管理器DNA Amplicon分析模块v1.1或更高版本可用于分析样本ID。
示例ID清单信息内置于Use BaseSpace DNA Amplicon 2.0和Local Run Manager DNA Amplicon Analysis Module v1.1中。用户只需要单击示例ID选项进行分析。此外，示例ID清单文件可以在支持网站的Illumina面板下载部分的AmpliSeq中找到。
目标上的碱基显示了在参考基因组中映射到目标区域的总测序碱基的百分比。这个指标反映了a)被设计、合成和汇集的扩增子的碱基百分比和b）生成的序列数据映射到目标区域。
不。任何包含融合的RNA面板的清单文件在非加密格式中是不可用的。只有加密的清单文件可用。
没有提供关于所有RNA融合面板设计中包含的确切断点的信息。Illumina软件分析工具产生的结果文件提供了软件标识的任何RNA融合事件的详细信息。有关为您的面板进行评估的基因对的信息，请参阅面板的数据表。
Illumina软件包，包括BaseSpace Sequence Hub应用程序，不提供对齐文件作为分析的输出。目前，只提供分析结果的最终报告。要了解更多细节，请参考软件文档。
不。该软件只报告检测到的融合事件。有关为您的面板进行评估的基因对的信息，请参阅面板的数据表。