Illumina转录组人类基因表达组常见问题

本试验中使用的适配器是针对AmpliSeq工作流程进行优化的。Nextera或TruSeq适配器不兼容本试验。

参见内容和存储。

在相同的测序运行中，可以为Illumina设计运行3种不同的AmpliSeq，每种都带有条形码。然而，您的目标放大器尺寸和所需的覆盖范围必须在一次运行中实现。

建议使用2×151 bp成对端读取。

看到产品的兼容性。

您可以通过增加测序吞吐量(例如，更大的流单元输出或测序平台)或减少每次运行汇集的样本数量来控制覆盖率。

RNA扩增子分析工作流程可用于差异表达分析。RNA扩增子分析应用程序可以在BaseSpace Sequence Hub上获得。Local Run Manager有一个类似的RNA Amplicon分析模块，它使用了与BaseSpace序列中心应用程序相同的工作流和算法。

是的，在BaseSpace公共数据中有示例数据集。

目标上的碱基显示了在参考基因组中映射到目标区域的总测序碱基的百分比。这个指标反映了a)被设计、合成和汇集的扩增子的碱基百分比和B)生成序列数据映射到目标区域。