最佳实践

最佳实践

一致性

  • 为了确保样品之间的一致性,尽可能使用多通道移液管。定期校准吸量管。
  • 将冻融循环次数减少到不超过4次。如果您不打算在一次使用中消耗试剂,在初次解冻后将试剂分配到均分中,并重新冻结均分,以避免过度的冻融循环。然而,如果你进行整除,你可能没有足够的试剂来完成多次反应的全部数量。
  • 为了尽量减少人工再悬浮造成的样品损失,使用推荐的平板和平板振动筛来混合样品。

处理磁珠

  • 使用前,让珠子达到室温。必要时使用25°C水浴。
  • 使用之前,旋涡珠子,直到他们很好地分散和颜色看起来均匀。
  • 在样品中加入珠子后,用平板搅拌器在推荐的速度和时间内充分搅拌。在某些步骤中,完全重悬珠对优化性能至关重要,Illumina建议在定时摇动后上下移液10次,以确保样品完全重悬。
  • 为获得最佳结果,请将您的珠/样品混合物在室温下孵育整个规程中规定的时间。在推荐的孵育时间后,将珠/样品混合物收集到板底,进行简短的离心。
  • 将钢板放置在磁支架上,待溶液清除后再进行操作。在缓慢吸气时,将吸盘放在磁架上,注意不要干扰分离的磁珠。

避免交叉污染

  • 样品之间和点胶指数引物之间总是使用新鲜的吸液头。
  • 使用协议中规定的方法混合样品。
  • 使用耐气溶胶移液头可降低核酸携带和样品间交叉污染的风险。如果没有抗气溶胶的针尖,请小心移液以避免污染。

清洗过程中SPB清理

  • 一定要准备新鲜的80%乙醇进行洗涤。乙醇会从空气中吸收水分,影响结果。
  • 确保你把所有的乙醇从井底移走,因为它可能含有残留的污染物。使用P20多通道移液管去除残留乙醇,加速干燥。
  • 让至少10分钟的干燥时间在磁支架上,在室温下完全蒸发。剩余乙醇会影响后续反应的性能。
  • 不要超过推荐的干燥时间,因为过度干燥的样品会对样品恢复产生负面影响。

冷冻/解冻少量样本

  • 您的检测试剂盒提供的每种试剂都有足够的容量,可以使用8通道吸管和储液器或8孔带管一次处理试剂盒特定数量的样品。当使用试剂库处理小批量样品时,死体积和移液误差损失会增加。为确保所有样品都有准确的试剂量,用单吸管将试剂注入每孔。
  • 为了储存剩余的试剂,Illumina建议冷冻平分,而不是反复冷冻和解冻供应的试剂管。

防止PCR产品污染

  • 确保实验室的设置适当,以减少PCR产品污染的风险。有关更多信息,请参见防止PCR产品污染章节Nextera快速捕获富集指南

Low-Plex池指南

  • Illumina使用绿色激光器对G/T进行排序,红色激光器对a /C进行排序。在每个循环中,必须读取每个颜色通道的两个核苷酸中的至少一个,以确保正确的注册。重要的是要为正在排序的索引读的每个基保持颜色平衡,否则索引读排序可能会由于注册失败而失败。
  • 方法的“低plex池指南”一节中描述的说明Nextera快速捕获富集指南当池化少于6个库时,要确定哪些库是预先富集的。