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  • Nextera Rapid Capture Exome Targeted Regions Manifest v1.2 ReadMe

    Nextera Rapid Capture Exome v1.2清单文件中引入的更改。

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    < 1 MB

    2015年11月5日


  • Nextera快速捕获Exome v1.2产品文件

    Nextera Rapid Capture exome v1.2的发行说明、目标区域清单文件和外显子组探针清单。目标区域清单文件列出了GRCh37/hg19中214,126个具有起始和停止染色体位置的靶向外显子区域。


  • Nextera快速捕获Exome产品文件

    Nextera Rapid Capture Exome目标区域清单文件(*.txt和*.bed)和Exome探针清单。HiSeq分析软件需要TXT格式。

    • 目标区域清单文件列出了GRCh37/hg19中具有起始和停止染色体位置的212,158个目标外显子区域。
    • 外显子组探针清单文件列出了412,06个染色体定位在GRCh37/hg19的富集探针。

  • Nextera快速捕获扩展的Exome产品文件

    此下载包含Nextera Rapid Capture扩展的Exome目标区域清单文件(.txt和.bed),以及Exome探针清单。目标区域清单文件列出了GRCh37/hg19中具有起始和停止染色体位置的201071个目标外显子区域。扩展的外显子组探针清单文件列出了347,517个染色体定位在GRCh37/hg19的富集探针。

    “Nextera Rapid Capture Expanded Exome Targeted Regions Manifest”和“Nextera Rapid Capture Expanded Exome Probe Manifest”文件的格式为“。txt”。HiSeq分析软件需要此格式。


  • Nextera快速捕获外显子组vs.扩展外显子组重叠文件

    Nextera Rapid Capture Exome目标区域间隔重叠Nextera Rapid Capture扩展的Exome目标区域。两个产品之间的总重叠为33 MB: 188,621个外显子组目标区域的重叠间隔为189,522个(由碱基重叠决定)。

    例如,将Chr 1位置300-500的外显子组区域与Chr 1位置305-495的扩展外显子组区域进行比较,得到191bp的重叠和两个5bp的外显子组产物的独特区域。

    ダウンロード

    9 MB

    2013年4月5日


  • Nextera快速捕获扩展Exome独特的间隔文件

    Nextera Rapid Capture扩展外显子组目标区域间隔,不与Nextera Rapid Capture外显子组目标区域重叠。扩展外显子组共有29 MB,在47273个扩展外显子组目标区域中有50257个间隔(仅由碱基重叠决定)。

    例如,将Chr 1位置300-500的外显子组区域与Chr 1位置305-495的扩展外显子组区域进行比较,得到191bp的重叠和两个5bp的外显子组产物的独特区域。

    ダウンロード

    3 MB

    2013年4月5日


  • Nextera快速捕获Exome独特的间隔文件

    Nextera Rapid Capture Exome目标区域间隔不重叠的Nextera Rapid Capture Exome目标区域。外显子组有4.1 MB的独特区间:由碱基重叠确定,在205,598个外显子组目标区域中有336,295个区间。

    例如,将Chr 1位置300-500处的外显子组产物区域与Chr 1位置305-495处的扩展外显子组区域进行比较,得到191bp的重叠和两个5bp的外显子组独特区域。

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    17个MB

    2013年4月5日


  • HiSeq分析软件hg19参考基因组

    人类参考基因组hg19来自UCSC用于HiSeq分析软件。

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    5.8 GB

    2012年12月14日


  • HiSeq分析软件v0.9

    在Linux操作系统上安装和运行HiSeq Analysis Software (Version 0.9)所需的源文件、脚本和文档。


  • Nextera快速捕获数据的富集分析工作流程

    演示数据集,以验证安装在HiSeq分析软件(HAS)的丰富工作流程。它包括一个运行文件夹,其中包含10%的块从读取科里维尔样品,GM10861,使用Nextera快速捕获Exome试剂盒,复杂性为12。

    使用命令美元焦油-zxvf NexteraRapidCapture_DemoData解压*tar.gz文件夹。

    ダウンロード

    4.8 GB

    2012年12月14日


  • Illumina实验经理v1.11

    Illumina实验管理器v1.11是一个桌面工具,指导您构建库板和创建与MiSeq, nexttseq, HiSeq和NeoPrep系统使用的样本表。