输入要求

类型的DNA	支持扩增子的大小	输入(最高15 μl)	A260 / A280	FFPE DNA质量控制
高质量基因组DNA	150、175、250、425 bp	50ng(最低)250ng(推荐)	1.8 - -2.0	不是必需的
FFPE基因组DNA	只有150和175 bp	250 ng(最低)	1.8 - -2.0	Illumina FFPE QC Kit (WG-321-1001) Δ Cq≤2.0

输入DNA定量

Illumina强烈建议对起始基因组材料进行量化。使用基于荧光的定量方法，如PicoGreen，而不是基于紫外光谱仪的方法，量化起始基因组材料。以荧光为基础的方法，采用双链DNA (dsDNA)特异性染料，即使在许多常见污染物存在的情况下，也能对dsDNA进行特异性和准确的定量。相比之下，基于260 OD读数的紫外光谱仪方法容易高估DNA浓度，因为RNA和其他在gDNA制备中常见的污染物的存在。

DNA质量评估

强烈建议使用Illumina FFPE QC Kit来确定FFPE DNA的质量是否足以与TruSeq Custom Amplicon一起使用。此外，在260 nm处的吸光度与280 nm处的吸光度之比被用作样品纯度的指示。该方案对吸光度比为1.8-2.0的DNA进行了优化。