商业化的农业

基因组学在商品农业中的应用，如用于性状筛选的基因分型，已成为现代农业和育种实践中不可或缺的一部分。我们的微阵列和下一代测序(NGS)技术正在帮助育种家和研究人员评估和预测植物和动物的遗传价值，为有关选择和健康的关键决策提供信息。

在许多商业农业应用中，遗传信息已经在很大程度上取代了物理筛选，包括选择性育种。与特定价值性状相关的遗传标记可以用来筛选大量的后代，以确定那些具有所需特征的后代。性状筛选是多基因性状的理想选择，这些多基因性状难以使用常规育种或繁殖技术管理，甚至更难以通过表型识别。群体的迭代筛选使具有所需性状的后代更容易分离，用作种畜。Illumina为基于微阵列和测序的解决方案提供全面的组合，以帮助研究人员筛选群体和作物所需的性状。

回交在商业农业应用中的目标是将单一的利益性状，如耐旱、高产或抗病，从供体亲本转移到后代。利用Illumina微阵列或NGS进行标记辅助回交，使研究人员能够通过易于筛选的基因连接标记监测性状基因的传递。这一过程大大加快了回交程序，减少了释放商业上可行的株系或育种种群的时间。

遗传标记可以用来识别动物和了解后代与父母的关系。因为单个标记可能不会产生明确的结果，所以使用多个标记来增加识别真正父代的概率。在群体中存在多代雄性或雌性的系谱育种情况下，标记结果与育种者对可能的父系或母系的知识相结合，以确定亲本。

转基因生物(GMO)的分子特性对于事件选择和许多国家的监管批准都是必要的。NGS的简单性和一致性使该方法成为现有Southern blotting和PCR产物测序方法的一个更好的替代方法。对整个基因组进行深度测序可以确定插入位点的数量、每个位点的拷贝数、插入位点和天然位点的序列以及世代稳定性。