研究プロジェクトが新規生物種にフォーカスしたり,これまで遺伝ツールを使って調査されていなかった場合は,德诺维シーケンスが最初のステップとなります。このステップでは動植物の昨日と環境との相互作用の基礎となる遺伝情報を理解することができます。長いペアエンドとメイトペア技術から得られるシーケンスデータを利用し,研究者はゲノムをアセンブルすることでゲノムマッピングを行います。またSNPおよびその他の遺伝多型の探索のために,ゲノムアセンブル情報を使ってさらにリシーケンス解析を行います。
生物种种のリファレンスゲノムができ,遗伝子,snp,更多型のおよび遗伝型には全ゲノムリシーケンスが適したアプローチです。これらの解析で得られる情報は,現在の遺伝マップの隙間を埋め,育種選抜を向上し,生物種内および生物種間における比較ゲノム解析を可能にします。
RNAシーケンスは动词におけるにおける子発现ののの革探索探索で,発达や,ストレス下の遗伝子発现レベル変に新闻た明显をもたらしますます。的なRNA転写产物(mRNA,ノンコーディングRNA,低分子RNAなど)
,クロマチン构造,低分子RNA発现発现の化を调べること,研究者はエピジェネティクスの要因がどのようにこうした変化や形質に貢献しているのかを理解することができます。
ターゲットリシーケンスは,エクソームや大規模な関連解析などで得られたある特定のゲノム領域をディープシーケンスするアプローチです。効率よく経済的なこのシーケンス手法は,事前に決められたゲノム領域を多くのサンプルに対して解析することで,共通した,あるいは稀な多型(SNP, CNVなど)を同定することができます。これらの多型は育種決定の手助けとなるものであったり,動植物における病気や寄生の感受性に関連するものである場合があります。
次世代シーケンサー(ngs)を用作たジェノタイピング(GBS:通过测序基因分型)は,新しい動植物の新たなSNPを探索する低コストな遺伝スクリーニング手法で,ジェノタイピング解析を行うことができます。低コストのツールのためルーチンのスクリーニングとして使うことができ,育種の現場において投資利益を迅速化することができます。
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シーケンスはメタゲノム,解析を大きく変換しました。培養することなく,大規模な微生物集団を直接自然環境から解析できるこの手法により,動物の消化を促進する胃の微生物であったり,窒素固定に関係する根の微生物など,動植物の発生に関連する微生物集団の複雑性および多様性についての情報を手にすることができます。
次世代シーケンサー(上天)は微生物研究において,先端ツールとして活用されています。门店は既知情報を必要とせずゲノムを測定でき,培養することができない生物種においても解析が可能です。1塩基の解像度は,ラボあるいは環境における短期間の微生物適応性のトラッキングを行えます。
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PDFをダウンロード”“アクアゲノミクスをキーワードとして,世界の最新事例を紹介するランチョンセミナーを開催しました。展示ブースでは挥动による環境DNA分析に焦点を当て,ベンチトップシーケンサーを用いたアプリケーションをご紹介しました。
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