がん検出のためのゲノムバイオマーカー

組織生検に代わる非侵襲的手法としての血中循環腫瘍DNAの可能性

非侵襲的がんバイオマーカー

無細胞血中循環腫瘍DNA (ctDNA)は侵襲的な組織生検に代わる手法として,非侵襲的がんバイオマーカーとなる可能性があります。現在,さまざまな種類のがんを検出するバイオマーカーとしてctDNAを使用する手法が研究されています1。今後,治療反応性のリアルタイムモニタリングや治療候補同定の非侵襲的手法としてctDNAが台頭する可能性があります。2

次世代シーケンスは(门店),血中のわずかなctDNAの検出に必要な精度と特異性を提供します。门店では,単一遺伝子または一部の遺伝子をターゲットとするだけでなく,ctDNAにおける腫瘍由来の変異をゲノムワイドに同定することもできます。

これまで,がんバイオマーカーとして血清タンパク質が使用されてきましたが,この手法ではドライバー変異や腫瘍の不均一性に関する情報が得られないため,有用性には限界があります1。これに比べ,腫瘍DNAにおける体細胞変異は,特異的かつ精確なバイオマーカーとなります。门店が登場し,がんに伴うゲノム変化に関する知見が蓄積されることで,低頻度の体細胞変異を高精度で精確に同定できる可能性が高まっています。

根据Jo Vandesompele教授博士的说法,基于DNA分析的液体活检检测在癌症领域的应用正在迅速增长。他还看到了RNA分析在液体活检领域和肿瘤学领域之外的巨大发展机会。他讨论了正在进行的旨在破译长链非编码RNA在癌症中的作用的研究。

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长链非编码RNA在癌症中的作用

在未来,循环肿瘤DNA测序可能在癌症诊断、预后和治疗反应方面发挥作用。


ctDNA和液体活检在癌症中的未来潜力
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  • 在没有侵入性活检的情况下确定肿瘤中可操作的改变
  • 测量肿瘤的异质性
治疗反应监测
  • 确定治疗功效
  • 测试新的可操作的变更
残留病害监测
  • 评估病情缓解或进展
筛选
  • 在没有先前证据的情况下确定疾病的存在

ctDNA测序研究文章

来自血液的变异数据
分析胰腺癌样本的外泌体DNA

对胰腺癌患者血液中发现的外泌体DNA进行NGS分析,使研究人员对液体活检的潜力有了更深的认识。

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核小体模式
在ctDNA中寻找癌症驱动基因表达线索

ctDNA样本全基因组测序使研究人员能够分析核小体模式,推断癌症驱动基因的基因表达状态。

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液体活检样本
液体活检的力量和前景

Illumina首席医疗官Phil Febbo博士讨论了液体活检和循环肿瘤DNA分析的未来潜力。

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TruSight肿瘤科500 ctDNA

针对血浆中多种体细胞变异类型的研究,包括肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性。

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TruSight肿瘤UMI试剂

这些独特的分子标识减少了测序数据的背景噪音,使检测低频变异成为可能。

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NovaSeq 6000系统

结合可伸缩的吞吐量,速度和灵活性,几乎任何排序方法,基因组,和项目规模。

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癌症RNA序列

该方法提供了有关癌症基因表达和驱动肿瘤进展的基因融合的功能信息。

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体细胞突变分析

NGS具有高灵敏度、易于使用和准确的数据质量,甚至可以成功识别罕见的突变。

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Pan-Cancer分析

专家定义的泛癌NGS面板可以全面评估与许多常见癌症相关的基因变异和异常,无论肿瘤来源如何。

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今後はctDNAが,がんの診断,予後,および治療反応性の評価に利用される可能性があります。


がんにおけるDNAバイオマーカーの未来
コンパニオン診断
  • 生検を実施することなく,腫瘍におけるアクショナブルな変異を同定
  • 腫瘍の不均一性を評価
治療反応性を評価
  • 治療の有効性を判断
  • 新しいアクショナブルな変異を検査
残留疾患をモニタリング
  • 寛解または進行を評価
スクリーニング
  • エビデンスの得られていない疾患の有無を診断
图像
がんバイオマーカーとしてのctDNAの存在

無細胞DNAの解析により,がんの指標が見出されました。

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初期および末期ヒト悪性腫瘍におけるctDNAの検出

Bettegowdaらによる論文では,複数種の腫瘍でがんバイオマーカーとしてctDNAを使用例が示されています。

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ctDNAの超高精度定量法

纽曼らによる論文では,ディープシーケンス(CAPP-Seq)を行ってctDNAを定量する,がんの個別化プロファイリングを導入しています。

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転移性乳がんバイオマーカーctDNAの解析

道森らによる論文では,ctDNAを使用して転移性乳がんをモニタリングしています。

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超灵敏的ctDNA定量方法

Newman等人引入了通过深度测序(CAPP-Seq)对ctDNA进行量化的癌症个性化分析。

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ctDNA作为转移性乳腺癌生物标志物的分析

Dawson等人使用ctDNA监测转移性乳腺癌。

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药物开发
药物反应的RNA生物标志物

寻找旨在帮助您采用RNA- seq的药物反应RNA生物标志物发现和分析的资源。

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参考文献
  1. Bettegowda C, Sausen M, Leary RJ,等。早期和晚期人类恶性肿瘤循环肿瘤DNA的检测Sci Transl地中海.2014; 6:224ra24。
  2. DeMartin T(2014)基因迷航:下一代测序的临床影响。农业科学(info.agscientific.com/blog/bid/203182/Gene-Trek-Clinical-Impacts-of-Next-Generation-Sequencing