微生物群は宿主免疫応答に影響を与えます
宿主の中に共生する微生物はがんの進行や治療有効性に影響を与えます。食事や薬は微生物叢の多様性を低下や,微生物叢の中の特定の微生物種が宿主免疫に局所的または全身的な影響を与えます1，2。
将来の治療では,既存のがん療法に有益な微生物の増殖の促進または有害な微生物の除去を組み合わせた方法の利用が期待されています。门店を用いた研究により宿主と微生物叢の相互作用を探索し続ける一方で,イルミナはこの分野の可能性を広げ,実現させることのできるゲノムテクノロジーの進化を追求しています。
がん免疫療法と微生物叢の役割
がん免疫療法の有効性は,腸内微生物叢の構成により左右される可能性があります。
ngsアプリケーションアプリケーションが実现実现する
门店は微生物叢の研究に革新をもたらしました3..ngsでは，个々の微生物の培养やクローニングがで，微生群内の何ものを同时に解析种同です解析すること可以です。大量ののですですですできるがですです。できるバイオインフォマティクスの情発にできるできるツールの〗开発，単一生
がんにおけるキープレーヤーとしての微生物叢
微生物叢ががんや免疫療法に及ぼす影響の概要および拡大し続けるこの分野の研究を発展させる上で挥动が果たす役割。
がん微生物叢解析ワークフロー
ハイスループットで高感度な挥动は,1つのサンプルに含まれる何千もの微生物種の同定を可能にします。
以下のをクリックしてワークフローの各ステップで使用する製品をご覧ください。
TruSeq链总RNA文库准备试剂盒
全RNA解析のための効率的,経済的および拡張性のあるソリューション。
Nextera XT图书馆准备工具包トランスクリプトランスクリプトームおよびメタトランスクリプトームの情解析するためのの，ウイルス，およびおよび他の生命物のの用ライブラリー调制。
TruSeq DNA PCR-Free文库制备试剂盒
全ゲノムシーケンスアプリケーション用のシンプルかつ包括的なライブラリー調製。細菌などの小さなゲノムからヒト全ゲノムまで,多種多様な生物のシーケンスが可能になります。
デスクトップシーケンスシステム
MiSeqシステム微生物学科分别で必要される幅広いアプリケーションにたスピード，精制，简介性実现実现。
NextSeqシリーズトランスクリプトームおよび全ゲノムシーケンスに適した柔軟なデスクトップシーケンサー。
ハイスループットシーケンスシステム
ハイスループットの微生物トランスクリプトームに適したパワー,そしてプロジェクトやワークフローのニーズに基づいて規模を変更できる柔軟性を実現。
Hiseq 2500システム.大規模ゲノム解析のためのパワーと効率。
4000年HiSeq 3000 / HiSeqシステム生産規模のゲノム解析のためのハイスループットと低コストを実現。
16 sメタゲノミクス
イルミナがキュレーションした绿色煤电分類学データベースを用いて16 s rRNAをターゲットとするアンプリコン配列のリードを分類学的方法で分類。
Krakenメタゲノミクスk-merによる精密なアライメントと新規の分類アルゴリズムを用いて高速かつ高感度に短いDNA断片配列を分類学的方法で分類。
metaphlan.
メタゲノム系統解析(MetaPhlAn)ツールは,メタゲノムショットガンシーケンスデータから微生物群の構成をプロファイリングします。
奇摩预处理およびQIIME可视化定量见解微生物生态学(QIIME)はユーザーに生のシーケンスデータのみならずレポートに利用できる品質のグラフィックや統計情報が提供できるようにデザインされています。
关键词
16s rrnaシーケンス
16 sリボソームRNA (rRNA)シーケンスは,すべての細菌に存在する遺伝子マーカーをターゲットとしています。16s rrnaシーケンスは、複雑な微生物叢から得られたサンプルの系統解析と分類学的な分類を可能にするための確立された方法です。
ショットガンメタゲノミクスシーケンス
ショットガンメタゲノミクスシーケンスは,微生物種の同定および機能解析のために微生物サンプルに含まれるすべてのゲノム配列を解析します。シーケンスカバレッジを深くすることにより,微生物叢の中でも存在量の少ない微生物を検出することが可能です。
メタトランスクリプトーム解析
メタトランスクリプトーム解析は,RNAシーケンス(RNA-Seq)を微生物叢サンプルに適用することで,サンプルに含まれる微生物種の同定と,それらがどのような遺伝子を発現しているのか,環境変化にどのように応答しているのかを調べます。
追加のリソース
参考文献
- 肠道微生物群与造血干细胞移植:我们的立场是什么?骨髓移植。2017;52(1):7-14。
- 微生物组与癌症。中国癌症杂志。2013;13(11):800-812。
- 生物信息学与生物信息学:生物信息学与生物信息学。Nat Microbiol.2015牧师,13(6):360 - 372。