がんトランスクリプトームの理解
がんRNAシーケンス(RNA-Seq)による遺伝子発現およびトランスクリプトーム変化のモニタリングは,腫瘍の分類や進行の解明に役立っています。がんは多数の遺伝的変化を蓄積しますが,通常,腫瘍の進行を進めるものはほんのわずかです。がんRNA-Seqは,がんサンプルで発現した変異の断定に役立っています。
がんRNA-Seqはトランスクリプトーム変化を検出
コーディング領域あるいはがんにおける全トランスクリプトームのシーケンスを行うことにより,腫瘍の遺伝子発現変化に関する貴重な情報を得ることができます。がんRNA-Seqは遺伝子調節の重要な要素の一つである,ストランド特異的な情報の検出を可能にします。がんにおけるトランスクリプトームシーケンスにより,コーディングおよび非コーディングRNAのいずれもキャプチャーし,発現ダイナミックスを俯瞰するストランド情報が得られます。
RNA-Seqの詳細はこちらターゲットがん遺伝子発現プロファイリング
ターゲットRNAアンプリコンシーケンスにより,特定のがん遺伝子の発現を解析することができます。あらかじめ設計されたがん遺伝子発現パネルは,p53, NF - BΚなど関連のある経路をターゲットにしています。研究者はカスタムコンテンツを追加して,実験の範囲を広げることができます。
ターゲットアンプリコンRNA-Seqについての詳細はこちらがんトランスクリプトーム内の小RNA
削除または増幅されたmicrorna遺伝子座を含むゲノム領域は,複数のがん種に関連付けられてきました。小RNA-Seqによって,micrornaやその他のがんトランスクリプトーム内にみられる低分子の非コーディングRNAを発見し,プロファイリングすることが可能になります。
低分子RNA-Seqの詳細はこちらがん細胞のシングルセルRNA序列解析
個々のがん細胞をシングルセル解析行うことによって,腫瘍の進行や転移,治療効果をよく理解できるようになります。高感度の挥动ベースRNA-Seqは単一細胞を含む,低いサンプルインプット量でのがん遺伝子発現解析を可能にします。
シングルセルによるRNA-Seqの詳細はこちら
イルミナ製品
イルミナはがんRNA-Seqのためのライブラリー調製,シーケンス,データ解析などの選択肢を提供します。効率化されたライブラリー調製ワークフローおよび柔軟なキット構成によって多くの試験デザインに対応できます。イルミナシステムは業界をリードするデータ品質を実現しており,実際に,世界のシーケンスデータの約90%が1塩基合成反応(SBS)ケミストリーに基づくイルミナのシーケンサーを用いて産生されています。
BaseSpace内のタッチパネル操作のアプリケーションはデータ解析を単純化しているため,データ解析に費やす時間を減らし,新たな発見に向けた作業に割けるを増やすことができます。
以下のをクリックしてワークフローの各ステップで使用する製品をご覧ください。
TruSight RNA Pan-Cancer
1385のがん関連遺伝子をターゲットとし、FFPEを含むすべての種類の核糖核酸サンプルにおける遺伝子発現、変異、融合遺伝子を検出
170年TruSight肿瘤固形腫瘍進行に寄与する一塩基多型(SNV)的増幅,融合を検出する包括パネル
TruSeq RNA外显子组FFPEおよび他の低品質のサンプルから抽出したコーディング核糖核酸をシーケンスする、経済的で再現性のある経済的な手法
用于Illumina定制RNA融合面板的AmpliSeq融合遺伝子と遺伝子発現を検出するカスタマイズ可能なターゲットパネル
TruSeq基因库制备试剂盒
アンチセンス転写産物の検出,選択的転写産物や融合遺伝子,アリル特異的な遺伝子発現などの発見のためのmRNAストランド情報を精確に測定します。
TruSeq链总RNA文库准备试剂盒トランスクリプトームの全体像を捉え精確なストランド情報を提供する,全トランスクリプトーム解析用の拡張性の高いソリューション
TruSeq小RNA文库准备试剂盒microRNA解析用の感受性キット
用于Illumina定制RNA面板的AmpliSeq1200年最大のターゲットを対象とするカスタムRNAパネル
迷你们システム
低スループット遺伝子発現プロファイリングのための,最もシンプルで経済的なソリューション
MiSeqシステムシンプルなNGSワークフロー、統合化されたデータ解析ソフトウェア、および比類のない精確さを備えたデスクトップ型シーケンサー
NextSeq 550システム全トランスクリプトーム解析およびがん遺伝子発現プロファイリングを含むさまざまながんRNA序列アプリケーションを実行するための柔軟なデスクトップ型シーケンスシステム。
2500年HiSeqシステム
大規模ながんRNA-Seq実験用の高スループットシステム
HiSeq 3000/HiSeq 4000システム生産規模のがんRNA-Seq実験に対応した極めて高いスループットのシステム
6000年NovaSeqシステム事実上、いかなるゲノム、シーケンス方法、プロジェクトのスケールにも対応した拡張可能なスループットと柔軟性
RNA表达アプリ
明星アライナーでRNAリードをアラインしたのち,DESeq2で差異的遺伝子発現解析を行います。
大礼帽对齐アプリRNAサンプルのためのスプライスアライメント,変異コール,およびリファレンスの定量化を行ないます。
袖扣组装与拆卸アプリ核糖核酸サンプルで新規転写産物のアセンブリおよび差次的遺伝子発現解析を行ないます。
MiSeq记者
米塞克システムでの解析と変異コール用の使いやすいソフトウェア。
BaseSpace云または现场门店データの解析と管理を行うイルミナのゲノミクスコンピューティング環境。
NextBio研究研究者が疾患の機序、薬剤標的、バイオマーカー、および疾患予後バイオマーカーまたは効果予測バイオマーカーを特定することを支援するキュレーションされたゲノムデータで充実したライブラリー。
药物反应的RNA生物标记物
RNA测序(RNA- seq)越来越多地被用于发现和分析基于RNA的药物反应生物标志物。查找旨在帮助您采用RNA-Seq进行生物标志物分析的资源，包括工作流介绍、实验考虑和启动建议。
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