がんゲノムの全体像
がんの全ゲノムシーケンス(WGS)はがん組織にある固有の突然変異を塩基単位で捉えます。これにより1塩基多型(SNV)コピー数変異,構造多型などのがんに関連する新たな変異を発見することができます。腫瘍DNAと正常なDNAを比較することで,WGSはさらに特定の腫瘍サンプルに対する変異の全体像を示すことができます。
がんゲノムシーケンスによって,がんに関連する変異の多くが発見されています。がんの突然変異の分類や特性評価に関する現在進行中の研究には,癌症基因组图谱(TCGA)、国际癌症基因组联盟(ICGC)、癌症体细胞突变目录(COSMIC)などがあります。
がん全ゲノムシーケンスの利点
WGSにより,ゲノム全体の塩基対レベルの解像度が提供され,1回のランでSNV,挿入と欠失(indels)およびコピー数変異(CNV)が同定できます。WGSは周囲の正常組織と腫瘍のクローン性が一因であるものを含む,がん組織内の固有の突然変異の全体像を示します。
Tumor-Normal测序
通过肿瘤-正常全基因组测序，研究人员可以将肿瘤突变与匹配的正常样本进行比较。肿瘤-正常比较对于确定在癌症进展中作为驱动突变的体细胞变异是至关重要的。
Illumina提供按钮工具，以方便分析肿瘤正常WGS数据。
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肿瘤-正常研究中的体细胞变异召唤
通过肿瘤正常数据分析确定真实的体细胞变异。
肿瘤-正常WGS数据分析提示和例子
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基因编辑
CRISPR-Cas9基因组编辑允许科学家突变、沉默、诱导或替换基因和遗传元素。该技术具有广泛的应用前景，包括肿瘤相关研究，如询问肿瘤抑制基因、癌基因和免疫反应检查点基因功能。全基因组测序和靶向测序可以用来检查脱靶效应和确定特异性。
亚博官网人口イルミナ製品
イルミナはがんの全ゲノムシーケンスのためのライブラリー調製,シーケンス,データ解析を提供します。効率化されたライブラリー調製ワークフローおよび柔軟なキット構成によって多くの試験デザインに対応できます。イルミナのシステムは業界をリードするデータ品質を提供します。実際,世界のシーケンスデータの約90%はイルミナの1塩基合成(SBS)ケミストリーを使用して生成されています。
BaseSpace序列中心内のタッチパネル操作のアプリケーションはデータ解析を単純化しているため,データ解析に費やす時間を減らし,新たな発見に向けた作業に割ける時間を増やすことができます。
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Nextera DNA Flex Library Prep Kit
ヒト全ゲノムシーケンスからアンプリコン,プラスミド,そして微生物種までの幅広いアプリケーションに対応した迅速な統合ワークフロー。
TruSeq DNA PCRフリーライブラリー調製キット難しい領域に対しても高度なゲノムカバレッジを提供します。
TruSeq Nano DNAライブラリー調製キット
限られた脱氧核糖核酸サンプルでも効率良く実験を行えます。
2500年HiSeqシステム
ラピッドシーケンスランモードでは、わずか27時間でランを実行します。
4000年HiSeq 3000 / HiSeqシステム整列化フローセルテクノロジーにより,ハイスループット,1サンプルあたりの低コスト,および高速度,高性能を実現しました。
NextSeqシリーズ
複数のシーケンスアプリケーション用に,高スループットと柔軟性を提供します。
NovaSeq 6000システムほぼすべてのゲノム,シーケンス手法,およびプロジェクト規模に対応した拡張性のあるスループットと柔軟性。
BaseSpace腫瘍/正常シーケンスアプリ
腫瘍サンプルおよびマッチする正常サンプルのペアから体細胞変異を検出するよう設計されています。
BaseSpace序列中心门店データの解析と管理を行うイルミナのゲノミクスコンピューティング環境。
BaseSpace关联引擎
疾患機序,薬剤標的,および疾患予後バイオマーカーの特定をサポートする,キュレーションされたゲノムデータで拡大し続けるライブラリー。
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*数据计算存档。yobet亚洲Illumina公司有限公司,2015年版