複雑な疾患および遺伝性疾患研究
複雑な疾患の遺伝子構造の理解には,特定の疾患に関連する遺伝子バリアントを発見し,特性を解明することが極めて重要です。複雑な疾患はコモンバリアントによって特徴づけられることが多く,レアバリアントや低頻度のバリアントの要因については,ほとんど解明されていません。ゲノミクステクノロジーは,特定の多様な集団において,形質や疾患と相関するバリアントを同定するために,ゲノム全体にわたる遺伝子関連性の研究を可能にしています。
コモンバリアント探索のためのGWAS研究
ハイスループットゲノムテクノロジーを用いた全ゲノム関連解析(GWAS)は疾患関連のバリアントを発見するために,多数の患者の全ゲノムを迅速にスキャンできます。これには一塩基多型(SNP)とコピー数多型(CNV)が含まれます。アレイを用いた大規模GWASは,遺伝子座の同定や疾患関連のコモンSNPバリアント検出に,効率的かつ費用対効果が高い手法です。しかし,アレイでは低頻度SNPバリアントの検出に限界があります。塩基単位の解像度で全ゲノムシーケンスすることにより,疾患に関連する可能性のあるコモンおよびレアバリアントの両方を同定できます。
GWASの機会と遺伝性疾患
GWASは,まだ多くの疾患や疾病に対して実施されているとはいえません。また,現在までのGWASの参加者は,その大半(79%)がヨーロッパ系です。ヨーロッパの人口は全世界の約16%に過ぎないので,より多様なGWASデータセットの必要性が認識されています。2人種や民族の多様性に加えて,さまざまな疾患の特定のサブグループの多様な疾患適応症についてもGWASを実施する必要があります。これは,どの遺伝子および遺伝子パスウェイが疾患のメカニズムと病因に関与しているのかを探る手がかりとなります。
特定の複雑な疾患におけるバリアントの同定に成功
広く用いられているGWASのケース——コントロール法で,疾患のあるグループ(ケース)と健康なグループ(コントロール),2つの大きなグループを比較し,以下の複雑な疾患のバリアントを同定することに成功しました。
- 2型糖尿病
- 喘息
- パーキンソン病
- クローン病
- 各種の心疾患(冠動脈疾患,心房細動,心筋症など)
- 各種のがん(乳がん,大腸がんなど)
GWASの利点
- これまでに5万以上の形質および疾患との関連性が報告されており,新たなバリアントと形質の関連性を同定1
- 疾患の早期発見,予防,または治療に用いられるポリジェニックリスクスコアの開発,ならびに医薬品の開発,選定,投与など,臨床応用に活用できる遺伝型情報
- 容易に共有できるデータを生成し,大規模,多様化するサンプルセットの解析を促進
機能研究のためのバリアントの理解
研究者は,バリアントの相互関連性や疾患との関連性の理解に役立つつながりを見つけるために,集団およびグループを研究しています。ゲノミクスはこの研究を推進する上で不可欠です。研究でつながりを作り、ハッシュタグ#V2Fnowを使用し情報を共有してください。
参考文献
- 等。全基因组关联研究的优势和局限性。Nat Reviews.2019; 20:467 - 484。
- 马丁,A.R。目前多基因风险评分的临床应用可能加剧健康差异。自然Genetics.2019;51: 584 - 591