16 sリボソームRNA (rRNA)遺伝子シーケンスは,採取したサンプル中に存在する細菌を同定および比較するのに用いられる一般的なアンプリコンシーケンス手法です。16 s rRNA遺伝子解析は,研究するのが困難または不可能である複雑なマイクロバイオームや環境から採取したサンプルを系統学的および分類学的に研究するための確立した手法です。16 sの研究データは,種のレベルまで分類学上の割り当てを行うための感度および特異性を向上させるのに用いられます。
キャピラリーシーケンスまたはPCRをベースとするアプローチとは異なり,次世代シーケンサー(上天)は培養を必要としない手法であり,サンプル中の微生物群全体の解析を可能にします。これには他の手法では見かる可能性の低い種も含まれます。1回のシーケンスで多くのサンプルを組み合わせることが可能なため,微生物学の研究者は,次世代シーケンサーをベースとする16 s rRNA遺伝子シーケンスを費用対効果の高いテクノロジーとして用い,他の手法では見つかる可能性の低い菌株を同定できます。
こうした実験を行うには,複数のアプロ,チがあります。ワ,クフロ,のステップごとに,関連する製品をご紹介します。
以下のをクリックしてワ,クフロ,の各ステップで利用できる製品をご覧ください。
小さなゲノム(細菌,古細菌,ウイルス),アンプリコンおよびプラスミドを対象とするシーケンスが即可能なライブラリーであり,ワークフローは90分以内(ハンズオンタイム15分)に終了します。
タ,ゲットおよび低分子ゲノムシ,ケンスアプリケ,ション向けのスピ,ドと使いやすさ
最高出力15 Gbの使いやすいベンチトップ型シケンサおよび試薬
主にハイスループットのアンプリコンシーケンスデータを基にした,微生物群の比較および解析のためのオープンソースソフトウェアパッケージ
绿色煤电16S rRNA遺伝子デ,タベ,スと解析,,ル
テュ,ビンゲン大学(图宾根大学)によるメタゲノム解析用ソフトウェア
リボソ、ムデ、タベ、スプロジェクト(rdp)RDPは,オンラインデータ解析,整列化された注釈付きの細菌および古細菌小サブユニット16 s rRNAシーケンスなどのリボソーム関連データおよびサービスを科学界に提供します。
16 s rRNA菌叢解析用ツールQIIMEは著名な国際プロジェクトでも採用され,世界的に人気の高いソフトウェアパッケージです。運用の煩雑さが指摘されることの多いQIIMEですが,弊社BaseSpace序列中心ではクリック操作だけで簡単に利用できるアプリ版をご提供しております。
塩基に偏りがある低多样性サンプルの特徴と,そのラン結果でみられる傾向をご紹介し,クオリティやデータ量を改善させるポイントをご案内いたします。
16 s rRNAメタゲノム解析とは,環境サンプルなどから含まれる生物種について網羅的に解析する方法です。2013年イルミナ本社でに公表されました16 s rRNAメタゲノム解析について,そのプロトコールの詳細および特長などを解説します。
次世代シーケンサーを用いて16 sリボソーマル領域を対象とした細菌叢解析を,これから行おうと考えている方を対象とした研讨会です。
森永乳業株式会社食品基盤研究所において,腸内細菌解析を行なっておられる小田巻博士から,イルミナのデスクトップ型シーケンサーMiSeqを用いた最新の解析結果をご講演いただきます。
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