ショットガンメタゲノミクス
ショットガンメタゲノミクスは,採取した複雑なサンプル中に存在する微生物すべての全遺伝子の包括的な標本抽出法です。この手法によって,研究者は,細菌の多様性を評価し,自然環境および様々な条件下における豊富な種を検出することができます。ショットガンメタゲノミクスはまた,研究室で培養できないか,研究するのが困難または不可能な微生物の研究を可能にします。
キャピラリーシーケンスまたはPCRをベースとするアプローチとは異なり,次世代シーケンサーは(门店),研究者が何千もの微生物を並列してシーケンスできるようにします。次世代シーケンサーは,1回のシーケンスで多くのサンプルを組み合わせ,サンプル当たりの高いシーケンスカバレッジが得られるため,微生物群において,他の手法では見逃されるか,コストが膨大になり同定できないような非常に少数の微生物の検出を可能にします。
メタゲノミクス研究で用いられる方法には，他に16S rRNAシ，ケンスがあります。
ヒトの健康における細菌およびメタゲノム
メタゲノミクスムは最も急激な成長を遂げている科学専門分野の1つであり,ラボでは培養不可能な微生物のDNAを研究します。近年のシーケンステクノロジーの向上により,環境サンプルまたは臨床サンプルから直接得られた個々の微生物から特別な培養法を使用することなくほぼ完全なゲノムアセンブルを得ることができました。このようにメタゲノミクスムのシーケンス情報が急増したことで,微生物集団およびそれらが環境と人間の健康に及ぼす影響に対する新たな認識が生まれました。
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ショットガンメタゲノミクスワ，クフロ，のご提案
こうした実験を行うには多くの手法がありますが,それらの手法はワークフローのステップごとに製品としてご提案することができます。
以下のをクリックしてワ，クフロ，の各ステップで利用できる製品をご覧ください。
Nextera DNA Flex库准备试剂盒
ヒト全ゲノムシーケンスから,アンプリコン,プラスミド,微生物種まで,幅広いアプリケーションのための迅速で統合されたワークフロー。
Nextera XT图书馆准备套件小さなゲノム(細菌,古細菌,ウイルス),アンプリコンおよびプラスミドを対象とするシーケンス用ライブラリーで,ワークフローは90分以内(ハンズオンタイム15分)に終了します。
TruSeq DNA pcr免费文库制备试剂盒
全ゲノムシ，ケンスアプリケ，ションを対象としたシンプルで包括的なサンプル調製。細菌などの小さなゲノムから全ヒトゲノムまで，多種多様な微生物をシ，ケンスできます。
ベンチトップシケンサ
MiSeqシステムタ，ゲットおよび低分子ゲノムシ，ケンスアプリケ，ション向けのスピ，ドと使いやすさ
MiSeq v3试剂试剂盒クラスター密度を高め,リード長を向上し,シーケンスクオリティスコアを改善するために最適化されたケミストリー
MiSeq v2试剂试剂盒カトリッジに調製不要の試薬を充填したMiSeqシケンス試薬。サンプル量の少ないアプリケション用にマクロとナノキットも利用可能
NextSeqシリ，ズエクソム，トランスクリプトム，全ゲノムシケンスに適したデスクトップシケンサ
NextSeq 500/550 v2套件データ品質の向上とエラーのないリード数の最大化を達成する高スループットシーケンスのパワーをデスクトップ型システムにもたらします。
ハスルプットシケンサ
HiSeq 2500システム大規模ゲノム解析のためのパワ，と効率性
HiSeq 2500试剂盒最高出力600gbのハ
HiSeq 3000/HiSeq 4000システム
ハ▪▪スル▪▪プットで低コストな生産規模ゲノム解析
HiSeq 3000/4000 SBS试剂盒およびPE集群试剂盒整列化フローセル技術を活用し,1回のデュアルフローセルランで最大1500 g (1.5 tb)のデータを産出
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追加リソ，ス
参考文献
- Baker BJ, Sheik CS, Taylor CA, Jain S, Bhasi A，等。(2013)微生物群落转录组组装揭示深海碳氮循环的贡献。ISME J 10.1038/ismej.2013.85。
- McLean JS, Lombardo MJ, Ziegler MG, Novotny M, Yee-Greenbaum J，等。(2013)利用高通量单细胞基因组学平台从医院的生物膜中回收病原体牙龈卟啉单胞菌的基因组。基因组Res 23:867-77。
- Schofield MM, Sherman DM.(2013)天然产物生物合成原核基因簇的元组表征。Curr Opin生物技术:10.1016/j.copbio.2013.05.001。
- Neafsey DE.(2013)基因组测序揭示了疟疾寄生虫中新出现的耐药性。Nat Genet 45:589-90。